1、南瓜疫病疫病主要为害南瓜的幼苗、茎叶以及果实，发病初期病部出现褐色的病斑，空气湿度较大时迅速扩散，出现水渍状的软腐区，病部周围出现白色霉状物，最后导致果实枯萎腐烂或植株腐烂死亡。
防治方法：选择地势较高、土质疏松、排水良好的地带植株，最好与小麦或玉米等作为轮作。此病主要采用防治方法，种植前对种子和土壤消毒灭菌处理，平时加强管理，控制温度湿度。
2、南瓜白粉病白粉病主要为害南瓜的茎叶部位，发病初期叶片出现白色的小斑点，慢慢扩散，病斑逐渐扩大，最后病斑上覆盖一层白色的粉末，导致叶片发黄枯死。
防治方法：选择生长强健、抗病力强的品种，加强肥水管理，增强植株的抗病力，种植前还是消毒处理，隔绝病菌的感染，发病初期可用多菌灵可湿性粉剂或百菌清药剂喷洒防治。
3、南瓜炭疽病炭疽病主要为害叶片和果实，叶片发病时出现水渍状病斑，后扩散成褐色大病斑，高温高湿时病斑出现粉红色粘稠物；果实感染时，也是出现水渍状病斑，逐渐扩大，最后病变位发黑腐烂。
防治方法：用福美双可湿性粉剂拌种消毒，消灭种子表皮携带的病菌，建议和玉米、小麦等农作物轮作，减少病害的发生。发病时用百菌清可湿性粉剂或代森锰锌喷洒，每间隔一周喷洒一次，连续2~3次后即可治愈。
4、南瓜霜霉病霜霉病是南瓜主要病害之一，主要为害叶片，发病时叶片出现水浸状黄色斑点，逐渐扩散，最后导致叶片形成黄褐色不规则的多角形病斑。在潮湿的环境下，病斑会长有灰黑色霉层，发病严重时，整个种植地一片枯黄。
防治方法：霜霉病以防为主，选择抗病力强的品种，种植时用多菌灵可湿性粉剂拌种消毒处理，加强田间管理，增强植株的抗病力。严格控制温度，加强通风条件，使用百菌清、多菌灵等药剂喷洒进行化学防治。
