有机肥和化肥的施用不能颠倒首先是以有机肥为主，化肥为辅，才能使瓜菜优质高产无公害。其次是有机肥必须腐熟。施用未腐熟的有机肥料，如鸡粪，会带入大量的盐类和病虫，如氯化钠、疫霉病菌、线虫虫卵等。导致施用未腐熟的有机肥后，还须费人力、财力去防病虫。因此，必须施用腐熟过的有机肥。另外，化肥的施用要避免单一，应根据不同棚菜需求比例合理配方施用。
磷元素和钾元素的施用量不能颠倒在瓜果蔬菜生产过程中，除了碳、氢、氧三大元素外，氮元素是植株形成的关键，磷元素、钾元素是果实形成的主要元素。据有关资料介绍，瓜菜产量形成要素中磷、钾比例为1：2—1：3，利用率分别是20%—30%，50%—70%。因此，在施肥过程中，一定要注意多施钾肥，合理配施氮肥、磷肥，这在坐瓜果之后尤为重要。过去爱偏施磷酸二铵的现象一定要避免。并且合理配合施用生物肥，以调控营养供给。
防治病虫、营养调控和浇水的次序不能颠倒如果浇水在前，而防病虫与营养调控在后，那么一方面营养生长过剩，生殖生长不足，轻者节间长，叶片薄，茎秆细；重者落花落果。另一方面，由于浇水后，棚内湿度加大，难免使疫霉病、腐霉病、霜霉病等病菌繁殖加快，病害加重。因此，必须先用药预防病虫害，先用抑制剂，调控生长势，然后浇水施肥，才能避免自相矛盾产生问题，才能增产。
造墒浇水与移栽定植的先后不能颠倒在一些地区，在浇水造墒与菜苗移栽先后上出现过失误，造成了死苗现象。现在很多菜农先把有机肥撒在棚内，再撒施化肥，然后耕翻，平整后起垄定植菜苗，然后浇水。这个过程使得幼苗根系失水，容易和肥接触造成烧根，或者造成氨气中毒。如果先浇水，肥料经过了水的溶解和稀释就不容易再产生烧根，也不易产生气害了。因此建议：先浇水造墒，然后栽苗，再用氨基酸腐殖酸肥液灌根，注意7—10天灌一次，连灌3—4次。
