贮藏的条件适宜菜花贮藏的温度为0℃，空气相对湿度为90%-95%，贮藏时间为2-3个月，好花率可达75%-85%。贮藏温度高易散花，温度低易受冻。湿度高花球易变黄、变暗、感染病菌，湿度低易脱水萎蔫。
贮藏方式①假植贮藏。贮藏场所选择在背风向阳处，入冬前后将尚未成熟的幼小花球或生长不足的菜花连根从地里拔出，按行距26厘米、株距9-13厘米进行假植。②窖藏。将已成熟的花球连同2-3轮叶片捆扎在一起，留3-4厘米长根，装筐放在菜架上，给予适宜的温、湿度。窖温高时可在夜间通风，白天关闭窖门及通风口，定期翻动检查。有的用薄膜覆盖但不封闭。每天轮流揭开一侧的薄膜放风有较好的保鲜效果。③冷藏。将成熟的菜花根部朝下码在竹筐中，用纸盖好花头，根据筐的深浅决定摆放花球的层数，切勿使花球高过筐沿。将筐按通风垛形式码于库中，库内温度要求控制在-0.5℃-2℃，每月倒筐一次，摘除脱落及腐败的叶片，并剔除不适宜继续贮藏的花头。④单花球套袋法。将单个花球装入聚乙烯薄膜小袋中，花头朝下放入箱或筐中，在0.5℃-2℃冷库中可贮藏6-8周，贮藏期为两个月以内的可稍带外叶，贮藏期大于两个月的最好不带外叶，以免外叶腐烂波及花球。
贮藏期病害主要有褐腐病、霜霉病、软腐病等。防治方法：及时烧毁田间和贮藏环境中的病残株和病叶；适时采收，尽量减少采前或采后运输时造成花球表面的各种机械损伤；用次氯酸钠等含氯化合物对库房及用具进行彻底的消毒；在0℃左右低温下贮藏可降低病害的发生率。
