长期化肥当家，果树首当其害。长期施用二铵、尿素、硫酸钾、复合肥、复混肥等化学肥料，破坏了土壤，给果树造成很多灾难性的问题。
大量施用未经发酵腐熟的农家肥。大量未经发酵腐熟的人、畜、禽粪直接施入果园土壤中，其携带的大量病菌、害虫、盐分等，都会对根系造成严重损伤，重者会造成烂根死树。为了省工、省力,采用穴施、沟施，挖沟（穴）少而小，把肥料填满穴、沟覆土，烧死根也是普遍现象。
长期放弃土壤管理，加剧土壤板结。果园长期不予整刨，春、夏灭草全部依靠灭草剂，只灭了杂草，而不能疏通土壤的通气性。致使活土层长期处于严重板结状态。
树体贮存营养严重不足。正常加强管理的果园户，喷药保叶，夏季追肥，秋施基肥，一切管理到位，保持了树体贮存营养充足，座果率很高。放弃管理的果园户，夏季不追肥，秋季不施基肥，树体营养严重亏缺，造成腐烂病泛滥成灾，很多果树被刨掉。
过量使用除草剂。一年内多次使用草甘磷除草，如操作不当，渗入土壤，对果树的地下根系造成伤害，从而导致地上部营养不良，出现黄叶现象，树势衰弱，影响翌年果树发芽、开花和座果。果园使用草甘膦还易引起土壤缺锌。由滥用草甘膦所引起的缺锌症状在苹果树、桃树上均有发生，严重者已危及到树体生命。
