青椒烂果原因很多，归纳起来大致有以下8种原因，生产中应根据不同原因“对症下药”及时防治。
一、软腐病引起的烂果
果实初有水渍状暗绿色斑，后全果软腐，具恶臭，果皮变白，干缩后脱落或挂在枝上。其他部位很少显症状。可喷施72%农用链霉素4000倍液或50%DT杀菌剂500倍液，7天1次，连喷2～3次。
二、炭疽病引起的烂果
果实接近成熟时易染病，初呈水渍状黄褐色圆斑，中央灰褐色，上有稍隆起的同心轮纹，常密生小黑点。潮湿时，病斑表面常溢出红色黏稠物；干燥时，病部干缩成膜状，易破裂露出种子。叶片染病，初为水渍状退绿斑点，后变为绿褐色，中部浅灰色的小斑。可选喷百菌清、甲基托布津和新万生等防治，7天1次，连喷2～3次。
三、脐腐病引起的烂果
果实脐部受害，初呈暗绿色水渍状斑，后迅速扩大，皱缩，凹陷，常因寄生其他病菌而变黑或腐烂。可于坐果后喷洒1%过磷酸钙或0.1%氯化钙。
四、黑霉病引起的烂果
果实病部初期颜色变浅，果面渐渐皱缩，并生有绿黑色霉层。可喷50%DT杀菌剂500倍液或58%甲霜灵锰锌400倍液防治，7天1次，连喷2～3次。
五、灰霉病引起的烂果
灰霉病以门椒、对椒发病较多，在幼果顶部或蒂部出现褐色水渍状病斑，后凹陷腐烂，呈暗褐色，表面出现灰色霉层。可用速克灵烟剂熏烟，也可用25%阿米西达1500倍液喷雾，7天1次，连喷2～3次。
六、疫病引起的烂果
多数先从蒂部染病，呈水渍状灰绿色斑，后迅速变褐软腐。潮湿天气，表面长出稀疏的白色霉层，病果干缩不脱落。其他部位如茎杈枝叶上，常有水渍状褐色斑。可喷64%杀毒矾与55%瑞毒霉混合液(50公斤水中，两药各加100克)或58%甲霜灵锰锌400倍液或47%加瑞农800倍液，7天1次，连喷2～3次。
七、绵腐病引起的烂果
果实受害腐烂，湿度大时，上生大量白霉。可喷50%DT杀菌剂500倍液或14%络氨铜水剂300倍液，7天1次，连喷2～3次。
八、日灼病引起的烂果
果实向阳部分受阳光直晒，使果皮退色变硬，产生灰白色革质状斑，斑易出现黑霉或腐烂。应及时浇水，改善田间小气候，均衡供水，可减少该病发生。
