首先、温室是封闭性设施，室内有害气体不易排除，如基肥使用量偏多，挥发的氨气多，室内蔬菜要遭受氨气危害，使叶片干边或发生枯斑，严重时叶片枯萎，直至死棵现象发生。
第二、蔬菜在进入开花结果期以前，其吸肥量仅为全生育期吸肥总量的1/6左右，此时期土壤肥料不宜多，多了不但引起烧苗现象发生，还易引起幼苗旺长，影响花芽分化，延迟结果时期。
第三、温室蔬菜因长期施肥量较大，土壤中各种营养元素并不缺少，缺少的是二氧化碳。而作物在幼苗期对二氧化碳的需求量很少，它是随着叶片数量增加逐渐增多的，进入结果盛期，对二氧化碳的需求量达到高峰。温室内的二氧化碳主要来自土壤中有机肥料的分解，有机肥料施入土壤后，其二氧化碳释放盛期大约在施肥后10～50天之间。大量的施用基肥，不但会引起烧苗现象发生，而且释放的二氧化碳因作物生育前期用量很少，绝大多数都浪费掉了。进入结果期后，需要的二氧化碳增多了，而此期土壤中二氧化碳释放盛期已过，二氧化碳供应不足，制约了光合效能的发挥，影响了产量的提高。
因此基肥使用量不宜过多，一般每亩施基肥2500～3000千克即可。应把大量的有机肥料在开花结果后分期陆续追施，以便源源不断地为作物光合作用提供足量二氧化碳。
