芹菜的叶柄开裂有两种情况，一种是在干旱情况下，突然降雨或者浇水，使得叶柄的细胞组织突然急剧吸水膨大，撑破表皮而引起开裂。多发生在降雨或者浇水以后。另一种情况是由缺少微量元素硼引起的。
防止芹菜叶柄开裂首先要增加使用农家肥，改善土壤结构，平衡土壤养分。另外就是要避免土壤的突干突湿，保持水分的均匀供应，小水勤浇。在芹菜进入快速生长期以后，可以结合喷施杀菌剂，加入0.2%的硼砂或者硼酸，对减轻芹菜的叶柄开裂有一定的帮助作用。
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