引起水产养殖动物疾病的病原主要有细菌、病毒、真菌、寄生虫以及一些藻类等，其中细菌引起的鱼类常见的症状有烂鳃、白皮、赤皮、竖鳞、细菌性败血症、细菌性肠炎、疖疮、打印病等，甲壳类常见的细菌性疾病有红腿、烂鳃、瞎眼、甲壳溃疡、荧光病等，鳖类常见细菌性疾病有爱德华菌病、穿孔病、红脖子病、胃溃疡出血病，蛙常见细菌性疾病有爱德华菌病、红腿病、链球菌病等。下面简单概述下鱼类常见的几种细菌性疾病。
烂鳃：病原为柱状纤维菌，主要危害草鱼、青鱼，常和传染性肠炎、出血、赤皮并发预防：清塘彻底，选择优良鱼种，发病时可选用强碘、三黄散、大黄精华素。
赤皮：病原为荧光假单胞菌，主要感染对象有青鱼、草鱼、鲤鲫和团头鲂。预防时注意保持鱼体表完整无损，这样细菌无法入侵，尤其在拉网、运输等过程尽量避免鱼体受伤，发病时可选用杀菌红、甲可净、多黄泰诺散等。
竖鳞：病原初步认为是水型点状假单胞菌，主要危害静水养殖池和高密度养殖池的鱼体，流水养殖池发生较少。预防：在捕捞和运输时避免鱼体受伤，发病初期可加注新水以停止蔓延，可用3%食盐水浸泡病鱼5～10min进行治疗。
淡水鱼细菌性败血：病原为嗜水气单胞菌，其危害对象种类多，流行范围广。预防的重要措施就是清除养殖池底过多的淤泥，对于发病鱼翅用过的工具均需要消毒，病死鱼药及时捞出而不能到处乱扔，应及时深埋处理，鱼种减少搬运，就地培育，下塘前可用15mg/L的高锰酸钾进行药浴处理，流行季节可使用甲可净全池泼洒。
细菌性肠炎：病原为嗜水气单胞菌、豚鼠气单胞菌及肠型点状气单胞菌，全国各地均有发生，草鱼、青鱼最易发病，鲢、鳙也有发生，其中肠型点状气单包菌为条件致病菌，在水体中常有存在，当条件恶化、鱼体免疫力下降时就能导致疾病爆发。预防以保持水质清洁为主，严格执行四消四定的措施，治疗时可选用木质碘、PV碘，三黄散、肝胆康、肠舒宁等。
打印：病原为点状气单胞菌亚种，主要危害养殖对象为鲢鱼、鳙鱼，草鱼偶尔也有发病，其中花鲢、白鲢感染率有的高达80%，改症状的发生与操作受伤有关，尤其对亲鱼危害较大。预防时主要保持池水洁净，定期使用消毒剂对水体进行消毒，可选用甲可净、菌克等，使用时严格按照说明书进行，在日常管理中谨慎操作，尽量避免鱼体的受伤，同时避免寄生虫的继发感染。
疖疮：病原为疖疮型点状产气单包菌，主要危害对象有青鱼、草鱼、鲤鱼、团头鲂，鲢鱼、鳙鱼也有发生，预防时注意保持养殖水质的清洁，定期使用消毒剂对水体进行全面消毒，发病时可选用杀菌红、红色风暴等进行全池泼洒，在日常管理中谨慎操作，避免鱼体受伤。
鮰类肠败血症：是由鮰爱德华菌感染鮰类引起的，斑点叉尾鮰是最易感染该细菌的品种之一，预防时要在鱼苗源头和放苗之前做好准备，放苗前将池塘翻整后晒塘，工具、网箱网片等均用强碘稀释300倍后的溶液浸泡10～15min，对养殖水体进行消毒，因为斑点叉尾鮰为无鳞鱼，因此在选用消毒剂时应选择刺激性小的消毒制剂，加强管理，改善水水质条件，减少应激，放养密度不宜过大，经常加注新水，尤其在高温季节以降低水温。
弧菌病：弧菌属常见种类有鳗弧菌、副溶血弧菌、溶藻胶弧菌、哈维弧菌等，弧菌在海洋中是最常见的细菌类群之一，可感染鲆鲽类、鲑鳟类、鮰类、鳗鲡等鱼种，弧菌也是典型的条件致病菌，其病害的发生往往是由于外界环境恶化所致，因此预防时以保持优良水质为主，定期清除池底过多淤泥，并全面消毒，可选用弧菌克星，日常加强饲养管理，使用优质饵料。
