常见的菜苗浸染性病害有猝倒病、立枯病、炭疽病、叶斑病。这类病害发生快，而且可以互相传染，常造成缺苗断垄，要注重防治。
一、栽培防病坚持轮作制，不在同一地块连续培育同一种蔬菜苗子，不选择地势低洼易积水的地块作苗床，苗床要有相应的排灌设施。苗床土或营养钵内的土壤要选择无病土进行育苗，避免苗子受到病虫害的侵染，影响苗子的质量。精细整地，适时播种，注意播种深度，盖土不过厚，使种子能迅速萌发出苗，可增强幼苗的抗逆性。增施腐熟的有机肥料，满足苗子对各种营养元素的要求，确保苗木健壮生长。
二、种子消毒在播种前一定要精选种子，淘汰弱种，这是因为弱种发芽率低，而且往往是病害的初浸染源，容易感染病害。所以在播种前，可将种子用清水预种浸10至12小时后，再用500倍（1两兑2喷雾器）的高锰酸钾药液浸30分钟，以杀灭种子上的病菌。
三、土壤处理土壤是多种病源和虫源的聚集地，因此土壤处理是避免苗期出现病害的关键措施。具体的做法是在播种前2至3周将土壤耙松，可用50％多菌灵可湿性粉剂或10％甲基托布津或50％炭疽福美等或恶霉灵等杀菌剂，每平方米用药8-10克，加拌干细土10-15公斤，拌成药土，在播种前先将三分之一药土均匀撒施作垫土，播种后再将剩下的三分之二药土作为覆土，并保持土壤湿润。
四、培养壮株蔬菜出苗后，可用968激抗菌及苗宝等进行灌根或叶面喷雾，可促进幼苗对各类养分的吸收，保证蔬菜苗子成为壮苗，减少多类病害的发生。
五、药剂治疗蔬菜苗期最容易发生的病害有猝倒病（腰烂）、立枯病、疫病等几种病害，要加强防治，避免造成重大损失。对于根病，可喷普力克500到700倍液（1两兑3至5喷雾器）进行叶面喷雾，7至10天一次，可连续喷洒2至3次。喷药后土面湿度过高时，可撒草木灰降低湿度。
