在我省大部分地区棚室栽培中，黄瓜的污染主要来自肥料中的硝酸盐和农药中的有害物质。如何减少黄瓜的污染，达到无公害标准，我们认为：关键是栽培中把好"三关"。
一、把好施肥关。黄瓜中的硝酸盐污染来自肥料，科学施肥是防止（减少）黄瓜污染的主要措施。底肥施用上采取有机肥与无机肥相结合的方法，以有机肥为主，有机肥必须充分腐熟，禁止施用生粪。化肥要采用平衡施肥，即按黄瓜适合的氮、磷、钾肥比例进行配方施肥，整个生育期禁止追施硝态氮，追肥以生物肥、有机肥为主，适量施用铵态氮肥。
二、把好播种前、定植前消毒关。黄瓜种子表面常附有炭疽病、细菌性角斑病、枯萎病等多种病原物，为防止病害随种子传播，播前进行消毒十分必要。最简便、经济、实用的方法是温汤浸种，方法是将种子在凉水中浸湿，再用50-55℃的热水烫种，要不停的搅拌种子，当水温下降时，再加入热水，使烫种水温稳定在50-55℃，10-15分钟后，把种子捞出放在冷水中，消除种子内部余热。也可用福尔马啉进行种子消毒，方法是将种子浸湿，再用40%福尔马啉100倍浸种15-20分钟，捞出种子用清水洗净。种子消毒也可以对具体的病害使用专用药剂，如疫病用甲霜灵浸种，病毒病用磷酸三钠浸种等。多年种蔬菜的土壤中也有多种、大量的病菌，在很大程度上决定发病的种类和程度，因此，土壤消毒也很必要。常用药剂有五氯硝基苯、多菌灵等，针对具体病害使用专用药效果更好。在连续种植蔬菜的棚室里，在棚架、墙体、植物残体、地表等残留病菌的部位，定植前彻底清除残枝落叶，然后用硫磺、敌敌畏熏蒸，每亩按硫磺2-3公斤，DDV0.25公斤，拌锯末，点燃熏蒸一昼夜，能够有效杀死虫源，减少病源基数。
三、把好生长期温湿度控制关。每一种病害的发生与传播，都与环境条件有密切关系，而病菌适宜的环境与蔬菜生长适宜的环境，一般情况下是存在着差别的。我们把病菌繁殖、侵染适宜的环境条件与蔬菜生长适宜的环境进行比较，利用植物与病菌所需适宜环境条件的差别进行生态防治。通过控制温湿度，对黄瓜霜霉病进行生态防治就是很成功的一例。黄瓜生长发育适温25-32℃，生物学温度为10℃，湿度70-90%，而霜霉病发生的最适温15-24℃，湿度83%以上，叶片上有水滴或水膜。温度低于15℃，高于25℃，对霜霉病有明显的抑制作用。利用黄瓜生长发育与霜霉病发生所要求的最大适宜环境条件的明显差异对黄瓜进行变温变湿管理，可以实现黄瓜增产和减轻霜霉病的发生程度的效果。一天中每个时间段温、湿度至少有一个因子，对霜霉病发生实行单限制，就可大幅度减轻霜霉病的发生程度。在对黄瓜实行变温湿管理的同时，温、湿度至少有一个因子对灰霉病（发病适温18-23℃，适湿90%以上）、角斑病（发病适温24-28℃，适湿90%以上）的发生不利，也可明显减轻灰霉病、角斑病的发生程度。
在设施栽培中湿度是一个较难控制的因子，可以在设施内进行地膜覆盖，于膜下浇水，减少水分蒸发。黄瓜变温管理中，傍晚放风降温排湿，对减小夜间湿度也有明显作用。
对黄瓜进行生态防治的结果是减轻发病，而不是不发病，因此必要时还需药剂防治。为了确保生产的黄瓜是无公害的放心蔬菜，必须做到科学用药，不使用在蔬菜上禁止使用的农药品种，使用允许使用的农药品种也要注意用量（浓度），以及安全间隔期等。
