由于金针菇子实体具有很强的趋光性，菇体长2~3厘米时开始套纸筒，直到收获，用一定的光照可诱导菌柄向光源伸长。因此，在床架上方每隔3~5厘米吊一个15瓦的灯泡，可促进菌柄伸长。此阶段温度保持在8°C~15°C，相对湿度保持在85%~90%，二氧化碳的浓度保持在0.10%~0.15%为宜，这样可抑制菌盖开伞，促进菌柄伸长。约15天，菌盖直径为1~2厘米，菌柄长8~15厘米时即可进行采收。
采收时，一手抓住菌袋，一手伸入袋内，轻轻地抓住菇丛拔下，菇脚带木屑处要用小刀整齐地切去，残留在培养基上的菇脚要清除干净，促使下一批子实体现蕾。
