香蕉通常施用的肥料有速效性的化肥和迟效性的有机肥。
化肥包括尿素、硝酸铵、碳酸氢铵、硝酸钾、硫酸钾、氯化钾、过磷酸钙、钙镁磷肥、复合肥、专用肥、叶面肥(磷酸二氢肥、绿旺、植宝素等)，有机肥包括人畜粪尿、厩肥、垃圾肥、草木灰麸肥、堆沤肥、蘑菇堆料、河涌的淤泥、绿肥等。最近在生产上推广应用的环保生物肥料EM也应属有机肥。
化肥施用的效果较明显，产量较高，常用作追肥。施用化肥效果来得快也较方便，故商业性蕉园主要以施化肥为主，但长期过量施用化肥也会造成土壤及排水渠营养过剩造成下游河流污染，土壤物理机构被破坏，果实品质下降人们常说现在的香蕉不如过去的好吃。所以国外早已提倡施迟效性有机肥为主的施肥方式，称“有机农业”或“环保农业”。
