注水法可用市场上现成的注水器，也可自制。自制的方法是把农用喷雾器的喷头锯掉，喷杆顶端制成尖状，在喷杆头部30厘米以内打几个出水孔，即制成一个食用菌补水器。这样把喷杆插到菌棒内就可流水了。
浸水法在出菇棚附近挖一地沟或用水泥抹一水池，然后把菌棒堆放于池内，表面压上石头等重物防止菌袋浮出水面，然后放水使菌袋全部浸在水中，注意及时加水，保持原来水位，这样浸水8~24小时使菌袋含水量达到70%。
砌墙补水法把菌棒的塑料袋撕去1/3，然后将有塑料袋的一头向外，两架并一架同砌，中间相隔15厘米。注意不要太近，以免温度升高烧菌。中间放比较硬一点的营养土，层与层之间抹软一点的营养泥，高度砌12层以下，以免倒垛。上砌水池。出一潮菇后补水。
脱袋补水法将塑料袋全部剥去，竖排成卧排于1～1.2米宽的阳畦内，排列要紧凑，填入营养土，料面覆土厚1～2厘米，往阳畦内灌大水，使培养料吸足水，按常规方法管理。
