冬季利用棚室栽培蔬菜，由于大多连年种植，土壤、架材、墙壁等处有大量病菌积累，成为蔬菜病害发生的初侵染源，尤其是土传病害发生更为严重。同时，由于地温低，不利于蔬菜定植后发根，容易出现僵苗甚至死苗现象。为确保冬季蔬菜定植后健壮生长，必须注意以下几点。
深翻整地将棚室内上茬作物的残枝落叶清理干净，然后深耕30厘米以上，使30～50厘米深的土壤疏松通透。
土壤消毒结合整地用95%噁霉灵水剂450倍液对地面喷洒，然后翻入土中。也可以根据棚室常年病虫害发生情况，有针对性地选用多菌灵、福美双、五氯硝基苯、辛硫磷等杀菌剂和杀虫剂，与适量干细土拌匀后撒于地表，然后翻入土中。
熏蒸消毒定植前2～3天选晴天用硫磺、敌敌畏烟剂、百菌清烟剂等熏蒸。熏蒸后密闭棚室2天，然后对棚室通风。注意熏蒸时要将农具、架杆等一并放入棚内消毒处理。
基肥要腐熟没有经过腐熟的有机肥中有许多病菌和虫卵，施入后易导致病虫害发生，而且有机肥在腐熟过程中会受到大量的热，容易造成蔬菜烧根烧苗现象，并在棚室内产生大量氨气、二氧化硫等有毒气体，容易使蔬菜受到气害。因此，蔬菜定植前施用基肥时，要采用充分腐熟的有机肥。
提高地温冬季土壤温度较低，蔬菜定植后不利于扎根，而且土壤湿度很大，容易发生沤根现象。因此，蔬菜定植前应选晴天密闭棚室2～3天，提高棚内温度，以提高地温，使蔬菜定植后尽快扎新根、早发苗。
