无公害蔬菜对农药的要求除了高效、速效外，最主要的是要安全、低毒、低残留，其药剂可在自然界迅速消解，不污染环境，对天敌、授粉昆虫等少伤害，对蔬菜不产生药害。
适用于无公害蔬菜生产的农药生物农药：生物农药对害虫具有控制特效，且是安全性极高的农药，具有高效、低毒、无残留、抗药性慢等特点。如细菌杀虫剂BT、阿维菌素、参碱植物杀虫剂、真菌杀虫剂（白僵菌）、昆虫病毒杀虫剂及昆虫信息素类（性诱剂等）。植物源农药：对害虫有拒食、驱避、阻碍发育、干扰生殖等特异作用的植物提取物（印楝素、川楝素等）。昆虫生长调节剂：可通过阻碍害虫脱皮，干扰发育起到控制作用，对人及高等动物无害，对天敌影响小，对环境安全，如抑太保、除虫脲、扑虱灵等。新型抗生素类制剂：如多杀霉素对抗性蔬菜害虫具有高效速效性，但对人和高等动物非常安全，且安全间隔期短，非常适合在菜田中使用。高效强选择性药剂：如氨基甲酸酯类的抗蚜威只对蚜虫表现出高效，而对其他生物无伤害。
无公害蔬菜生产中的农药施用对症下药：在充分了解农药性质和使用方法的基础上，根据病虫害种类，选用合适的农药类型或剂型。适期用药：根据病虫害的发生规律，严格掌握最佳防治时期，做到适时用药。对病害要求在发病初期进行防治，控制其发病中心，防止其蔓延发展，一旦病害大量发生和蔓延就很难防治；对虫害则要求做到“治早、治小、治了”。科学用药：要注意交替轮换使用不同作用机制的农药，不能长期单一化，防止病原菌或害虫产生抗药性。蔬菜生长前期以高效低毒的化学农药和生物农药混用或交替使用为主，生长后期以生物农药为主。使用农药应提倡低容量的喷雾法。选择正确喷药点或部位：施药时要据不同时期不同病虫害的发生特点确定植株不同部位，进行针对性施药，达到及时控制病虫害发生，减少病原和压低虫口数的目的，从而减少用药。如霜霉病的发生是由下边叶开始向上发展的，早期防治霜霉病的重点在下部叶片，可以减轻上部叶片染病。合理混配药剂：采用混合用药方法，达到一次施药控制多种病虫危害的目的。但农药混配要以保持原有效成分或有增效作用，而不增加对人畜的毒性，并具有良好的物理性状为前提。一般各中性农药之间可以混用；中性农药与酸性农药可以混用；酸性农药之间可混用；碱性农药不能与其他农药混用；微生物杀虫剂不能同杀菌剂及内吸性强的农药混用。要严格按照期限执行农药安全间隔期：菊酯类农药的安全间隔期5~7天，有机磷农药7~14天，杀菌剂中百菌清、代森锌、多菌灵14天以上，其余7~10天。农药混配剂执行其中残留性最大的有效成分的安全间隔期。
