6月上旬连续阴雨和暴雨，使得池塘水位骤升，使池水中的ph值、盐度、水温大幅度下降，氨氮、亚硝酸盐、硫化氢升高，水色变清，透明度加大，渔塘水体内原有的藻类、有益菌死亡，细菌、病原菌大量繁殖，藻相、菌相失衡等，导致水体环境因子发生突变，严重影响鱼类生长。 因渔塘水体环境因子突变，破坏了原有的生态平衡，特别是微生态平衡；再则，养殖鱼类受到风浪惊吓，易引起应激反应，使鱼类生理功能紊乱，免疫功能降底，极易发生感染甚至暴发疾病。
改善水质。水灾过后渔塘会被输入大量有害物质和泥浆，水体混浊，应定期施放生石灰20千克～30千克/667平方米，既可澄清水体，中和酸性，提高ph值，又可杀灭随雨水带入的一些病菌。有条件的可将浑水抽出，换注新水，以促进水体上下对流，提高溶氧。并定时使用EM菌、芽孢杆菌、活水宝、底改净、沸石粉等有益微生物制剂和水质改良剂，以达到降底氨氮、亚硝酸盐、硫化氢含量，改善渔塘水质和底部生态环境的目的，使溶解氧不低于4毫克/升，ph值控制在7～8.5之间,氨氮、亚硝酸盐分别控制在0.2毫克/升以下,硫化氢控制在0.1毫克/升以内。
培肥水质。水灾过后，由于雨水稀释，渔塘水质偏瘦，营养不足，浮游生物繁殖缓慢，须加强施肥，培育浮游生物。施放禽畜人粪200千克～300千克/667平方米。如缺少有机物，可用碳铵3千克～4千克/667平方米或尿素2千克～3千克/667平方米，也可用过磷酸钙4千克～5千克/667平方米，全池泼洒。同时，开动增氧机，使渔塘底部的有机质快速分解发酵，培肥水质。养殖户可根据不同的养殖品种采取相应的措施：对以养殖鲢、鳙、鲫鱼为主的渔塘，水色保持嫩绿色或茶褐色，透明度在20厘米～30厘米左右；对以养殖草、鲤鱼为主的渔塘，水色以草绿色或绿褐色为好，透明度在30厘米～40厘米上下；对养殖虾、蟹为主的渔塘，则重点要降底水体浑浊度，提高透明度，水色呈黄绿色或黄褐色为佳，透明度在40厘米～50厘米之间。
