鳜鱼的疾病预防，应从以下几个方面进行考虑：
1、选择好水源和控制好水质
作为鳜鱼养殖用水必须是清新、无毒、无污染、溶氧量高、含病原生物少的江河、湖泊和水库水。在养殖过程中，通过控制放养密度，冲水，换水，开增氧机，长期微流水，在池塘中种植一些沉水植物，定期泼洒生石灰等措施，保持养殖水体良好的水化学状况，如溶解氧在6毫克/升以上、pH值保持在中性或微碱性等，对鳜鱼疾病的预防均能起积极的作用。
2、严格实行消毒和检疫制度
（1）对养殖设施（如池塘、网箱、孵化环道、孵化桶、孵化缸等设备）的消毒，包括放养前的消毒和养殖过程中的消毒。放养前的消毒力求将水体中所有生物都杀灭掉，所以消毒药应采用高浓度；而养殖过程中的消毒主要杀灭部分病原体，用药时要在保证鳜鱼安全的浓度范围内使用。所用的消毒药有生石灰、漂白粉、二氯异氰尿酸、三氯异氰尿酸、硫酸铜等。最常用的是生石灰，尤其是在放养前的生石灰清塘，是目前世界公认的最为有效的清塘方法。
（2）对鱼体进行消毒和检疫，这主要是指在鱼苗鱼种下塘时进行的消毒，特别是对购进的鱼苗、鱼种和亲鱼，必须进行严格检疫，下塘前必须经过消毒，以防疾病传入。用于鱼体消毒的药物很多，如硫酸铜、高锰酸钾、漂白粉等，但对鳜鱼最常用的是2%食盐水浸泡10分钟左右。鱼体消毒的操作可在大木盆、大水缸或帆布桶等容器中进行，操作时应尽量避免鱼体受伤。
（3）对饵料鱼和工具的消毒。对饵料鱼的消毒方法与对鱼体的消毒方法相同，其目的是避免饵料鱼将各种病原体传给鳜鱼；对工具的消毒与对养殖设施的消毒相同，通常采用高浓度药物进行数分钟的浸泡，以杀灭工具上可能带有的各种病原体及寄生虫卵。
