大棚里种的黄瓜、西红柿、茄子、辣椒等蔬菜，具有生长快、成熟早、产量高、效益好等优势。因此，有些农民就以为“好种出好苗，好苗产量高”，便到大棚里选留菜种。其实，这种做法是错误的。因为大棚里的蔬菜生长期温度与外界自然温度不一致，致使大棚里的蔬菜抗逆性差，授粉程度低，种子成熟不够。而且由于大棚面积有限，长年育苗，不易调换茬口，随种子、土壤传播的病原菌会周而复始地发生危害。因此，不可用大棚蔬菜留种，以免造成不应有的损失。
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