进入冬季，菇蚊、跳虫等害虫往往在短期内给食用菌生产造成严重的损失。原西北农林科技大学蔬菜花卉研究所研究员李曼霞说，食用菌病虫害防治应，尽量采用物理防治措施，避免对食用菌产生药害和污染。
预防应有针对性
菇棚的修建：应远离村庄、垃圾场、粪堆等地，确保出菇环境远离虫源，可将原材料在强日光下曝晒，或进行发酵处理，杀死虫卵、活虫，尽量采取熟料栽培或用于制种。菌种质量关的选择：在制种过程中，须仔细检查、挑选，发现污染，立即淘汰，确保生产菌种纯度。防虫网位置的选取：菇棚通风口及进出口为佳，防治成虫飞入，在通风口及进出口撒布石灰隔离带，以防爬虫类害虫进入。
综合防治
对食用菌虫害的防治应以农业防治为主，以免造成污染。
水浸法防治害虫：有些害虫由于浸入水中造成缺氧促使原生质与细胞膜分离致死，瓶栽培的和袋栽培的可将水注入瓶、袋内，块栽培可将栽培块浸入水中压以重物，浸泡2-3小时，幼虫便会死亡漂浮。
利用害虫的习性防治：有些害虫特征明显，某些鳞翅目害虫个体大，颜色艳，可采用人工捕捉。瘿蚊有幼体繁殖的习性，怕干燥，将发生虫害的菌袋在阳光下曝晒1-2小时或撒石灰粉，使虫干燥而死。
诱杀害虫：对于害螨，可在菇床上铺上纱布，将刚炒好的菜籽饼撒一层在纱布上，螨就聚集于纱布上，将纱布在浓石灰水中一浸，螨便被杀死，对蚊蛾用黑光灯或节能灯诱杀。
药剂治虫：“菌种中有活虫或虫卵时，可将菌种装入大塑料袋中，按照每立方米空间4片的用量投入磷化铝，6小时左右解袋使用。磷化铝穿透力很强，能杀死菌块表层及内部的害虫，而对菌丝体及子实体的生长无影响，熏蒸时菇房要密闭，操作人员需戴防毒面具，熏完后菇房要密闭48小时，再通气2-3小时，才可以入内。
