网箱养鱼放养密度大、空间小、患病率高、传染快，采取平常的箱内直接泼药方法，常会使鱼病久治不愈，原因是网箱水体交换快，药效时间短，药力范围小（施药后，药物大部分溶解在水的表层，底层浓度很低甚至为零，而鱼因药物反应都会往网箱底部走），而且网箱养殖数量越来越多，对大水面水质的影响加剧，病原体不断增加，导致交叉感染严重。所以采取合适的方法既可以有效治愈和杜绝鱼病，还可以节约成本。
为了便于用药，网箱设置时，在四个角和四条底边的中点分别安装好一根网绳并把另一端系牢在网箱支架上。另外做好一个比网箱尺寸的一半稍大的布袋。
预防用药
预防以中药为主，采取挂袋和喂药饵的方法，以其他药物为辅，采取泼洒和喂药饵的方法。由于药物、饲料、水质和密度等因素影响，近几年来肝胆综合征比较普遍，选择中药相对比较安全，如地锦草、乌桕叶、菖蒲、松树针、苦楝树叶、蓖麻叶等，可以单独使用也可以多种同时使用。
挂袋：每个网箱选取四个点，每点一深一浅两个挂袋，这样才能使得整个网箱体均达到一定的药物浓度。
泼洒：将预设在网箱四个角和四条底边的网绳提起，使所有的鱼都在水深1米以上的水面上，加大浓度到10倍～20倍泼洒半个小时以上。
治疗用药
鱼种：鱼种的活动强度较小，将鱼种赶到网箱的一个角落，套上布袋，采取浸泡治疗，药物浓度为正常药量的10倍～20倍，不要一次性泼洒，应慢慢泼洒，用药时间根据鱼对药物的反应而定，一般是到病鱼有中毒反应时停止。
成鱼：大鱼活动强度较大，不宜聚集太密，可将鱼赶到网箱1/3或1/2范围（视鱼的数量而定），1米以内的水深，用竹杠分开，然后套上一个布袋（在整个网箱套布袋当然也可以，但是工作量相对更大），待鱼游动缓和后开始泼药，浓度加大到10倍～20倍，用药时间同鱼种方法。
喂药饵：手工投喂，每一把料多洒些，面积洒大些，尽可能使摄食能力弱的鱼多吃食。
用药疗程
网箱与池塘用药最大的差别是药物作用时间短，所以外用药每天至少要用两次，根据用药种类和病情轻重决定用药天数，细菌性疾病至少连用两天，寄生虫病至少一天，第二天、第三天再各杀菌一次。
