芹菜菌核病可危害叶片、叶柄和茎。一般叶片首先发病，呈暗色污斑，潮湿时表面密生白色霉层。然后向下蔓延引起叶柄和茎发病。受害部位呈褐色水渍状，速度大时形成软腐，表面长出白色菌丝，最后茎组织腐烂呈纤维状茎内中空，形成鼠粪状黑色菌核。农户一定要注意该病，做到早发现、早防治，减轻损失。
防治方法：发病初期开始喷洒70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或65%甲霉灵可湿性粉剂1000倍液，5~7天喷1次，连续防治2~3次。以上农药交替使用，可避免产生抗药性。
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