改善植株光照条件。光照不足是导致连阴天落花落果的首要原因，菜农可以在棚内安装专用的补光灯，在白天开棚时进行补光，在大棚的后墙增设反光幕，可以增加散射光的利用效率，增强辣椒的光合作用。更为重要的是，务必及时做好整枝工作。菜农应首先将辣椒的吊绳弄松，增大辣椒枝条的开张角度，加强整枝，去掉过多的枝条尤其是内膛枝，增大叶片的见光面积、减少营养消耗的作用，从而提高辣椒的坐果率。
降低棚内湿度，晃动植株，利于授粉。蔬菜开花授粉对湿度也是有要求的。连阴天棚内放风少，棚内湿度过大，容易导致辣椒花粉发育不良，活性降低，不能完成授粉。所以，在连阴天时也要注意在中午12点到下午两点的时间段内，间隔性放风2-3次，风口7-10厘米，每次放风时间在15分钟左右即可。这样，可在不明显影响棚内温度的前提下，尽可能降低棚内湿度。同时，菜农也可采取晃棵的措施，促进更多的花粉粘着到辣椒雌蕊的柱头上，保证授粉完成。
叶面补充营养。落花落果严重，与营养供应不足也是密不可分的。连阴天时菜农可以通过叶面补肥的方法，增强辣椒的长势。叶面喷施叶面肥，如含硼含锌的叶面肥及核苷酸1000倍混甲壳素1000倍的方法，为辣椒补充能量，提高植株抗性，从而减少因营养消耗过多导致落花落果量。
辣椒发生落花落果时，应及时喷用萘乙酸等植物生长调节剂保花保果，但使用量不能过大，应将使用量控制在30-40毫克/千克之间。使用萘乙酸后，辣椒植株叶片会出现2-3天的曲叶现象，几天之后会自行恢复。
另外，在防治病虫害时，为避免增加棚内湿度，应以使用粉剂或烟剂为主。喷雾时，要选择较好天气的上午进行，通风降低棚内湿度。但是对于菜农刚刚定植的辣椒，因为植株刚刚进入开花期，开花坐果能力较强，菜农应将辣椒的门椒、对椒疏除，以养棵为主，留取辣椒四门斗以上的果实，这样既可有效地促进坐果，又能提高辣椒产量。
