在果树栽培过程中，人们对果树干、枝、叶等病虫害防治比较重视，而对果树根部病害的防治常常忽视，使果树的产量和寿命受到严重影响。果树的根部病害有很多，要想使果树高产并延长果树寿命，必须重视对果树根部病害的防治。
主要病害圆斑根腐病：主要危害仁果类、核果类及核桃等果树。病株萎蔫、卷缩，叶片失水青干、主脉扩展有红褐色晕带，枝条干枯、皮层坏死易剥离；须根变褐枯死，病根基部有红褐色圆斑，深入木质部，根变黑死亡。根朽病：危害梨、苹果、山楂、杏等。病株局部或全株叶小而薄，黄化脱落。新梢短、果实小；根呈水浸状紫色溃烂，皮层和木质部之间有白色扇状菌丝、有蘑菇味，有荧光。白绢病：沙滩地、土壤黏重、排水不良的果园易发生。仁果类、核果类、葡萄、柑橘、酸枣均有发生。发病部位在根茎部，病斑呈水浸状褐色，上长白色菌丝，病部及地表裂缝中长褐色菌核。白纹羽病：危害多种果树。初侵细根，然后扩展到侧根、主根。病根表面有白色或灰白色网状菌丝层或根状菌索，在腐烂木质部产生圆形黑色菌核。生理性烂根：排水不良的黏质地，含盐量过大、地下水位太高或干旱缺水的果园易患病。根部长期积水、根部不长根毛、皮层腐烂；主根干枯死亡，叶缘枯焦、黄化。
防治措施增施有机肥料或施用菌肥及饼肥，增强树势；排出积水；切除菌根，消毒晾根、换无菌新土；用药剂消毒，可选用五氯酚钠250~300倍液、70%甲基托布津1000倍液、50%苯来特1000~2000倍液、70%五氯硝基苯，小树每株用药液50~100克，大树每株用药液150~300克，与新土混合施于根部。
