杀菌剂分为保护性、触杀性杀菌剂及内吸性杀菌剂。保护性、触杀性杀菌剂能在病原菌侵入植物之前把病菌杀死或阻止其侵入，使用植物避免受害而得到保护，这类杀菌剂不会进入植物体内，只沉积在作物表面，起保护作用，防病谱广，防效稳定，不易诱发病菌产生抗药性。内吸性杀菌剂具有内吸活性，对病菌有直接的毒杀作用、抑制作用或影响致病过程；或影响植物代谢，使植物对病菌的反应减轻或阻止病害发生，这类杀菌剂被植物吸收后在植物体内运转，从而杀死侵入病菌，容易诱致病菌抗性的产生。
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