1、脐腐病
该病害主要危害甜椒肉果，发病后，在前期容易呈现水渍状病斑，后期会转化成暗褐色的凹陷失水以后就收缩成一个小小的甜椒皮囊。
发病原因：如果甜椒缺钙或是土壤盐渍化比较严重，浇水不及时，就会造成甜瓜幼果发病。
防治方法：在种植甜椒过程中，进行合理的浇水施肥，尤其是铺设滴灌设施，采用滴灌系统均衡施肥浇水；然后采用地膜覆盖技术，可以保证土壤水分供应，减少病原菌侵害，花芽分化期，喷施硼肥、钙肥。
2、白粉病
辣椒发病后，初期在叶片背部出现白色的粉状斑点，然后主要从下部老的叶片开始浸染，而且老叶更易感染白粉病，严重时，还会出现厚厚的白色霉层，后期变黄坏死脱落。
发病原因：温室内的温度低，湿度高，很容易造成白粉病。
防治方法：在甜椒种植过程中，需要施入充足的磷肥钾肥，及时清除病残体，减少病源传播，浇水采用滴灌方式进行，降低温室的湿度。发病初期，可以使用25%的嘧菌脂悬浮剂，进行灌根处理，发病严重时，使用10%苯醚甲环唑的水分散粒剂进行喷施，防治效果很不错。
3、菌核病
在甜椒生长旺盛期，危害比较严重，主要危害甜椒叶片、果实、茎秆，发病后，出现水渍状的斑块病斑，同时病斑上会长出一些白色的菌毛。后期病斑会变为褐色。
防治方法：加强温室管理，出现的病残体及时清除，发病后，可以使用精甲霜灵·百菌清将病原菌杀灭，还可以使用霉菌脂类进行灌根，防治效果非常不错。
