草莓畸形果发生的主要原因是授粉受精不良，但其发生程度则与品种、花朵级次、访花昆虫、温度和湿度以及花期喷药等因素有关。应配置适宜授粉品种，选择花粉量多的品种作授粉品种；控制温度和湿度，温度宜控制在20℃～28℃。要适时放风以降温降湿。滴灌能有效地降低保护地内的空气湿度。花期只要地表不干，一般不需灌水；疏花疏果，疏除易出现雌性不稔的高级次花，及时喷施菜果壮蒂灵+新高脂膜可明显降低草莓畸形果率，且有利于集中养分，提高单果重及果实品质。
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