百合花谢了叶干了就可以倒出种子，种子保存的要诀是，低温，干燥，放在黑暗的地方更好。基本上非专业人士，种子保存个两年应该是没有问题的。 一般来说，百合很少用种子繁殖，因为出芽率不高，可以试试：
1、种球繁殖。采用次生小种球进行繁殖。该法见效快，病害少。百合的地上茎地表部分会长出1厘米--2厘米大小的种球(次生小鳞茎)，采收百合时留下，埋在沙里，秋播时作种用。
2、珠芽繁殖。麝香百合不产生珠芽，其他百合夏天在其叶腋处能长出蚕豆粒大小的珠芽(即气生小鳞茎)，每株可产生40粒以上。夏季气温不断升高，珠芽会脱落，应在脱落前采收，留作种用，当年9月--10月播种。
3、鳞片繁殖。这种方法繁殖系数高，较为常用。待鳞茎充分成熟后掘起，选肥大无病虫害的，用利刀把鳞片从基部切下，随即播于铺沙壤土的苗床中。播时基部朝下，各片距离3厘米，上盖细沙厚约6厘米，床土保持温度20℃--24℃，湿度80％--90％，培养15天，在鳞片的切口处会长出米粒大小的鳞茎体。30天后长叶，60天--70天即可长成直径1．5厘米左右的小籽球。用鳞片繁殖法要选无病健株，先经过35℃以上高温7天的越夏处理，才能发芽快而整齐。
百合挖出来怎么留种？
一、冷藏
选择颜色白净、个头适中且圆整，没有病害的种球，装入塑料密封袋，放入温度在0℃左右的低温环境中冷藏，如果是大规模贮藏，可以用保温箱装箱。湿度控制在百分之70左右，第二年春天可以出库种植。
百合
二、沙藏
取一个花盆，底部铺上一层黄沙，可以用薄土，但是薄土要喷洒适量水。将百合种球放到沙子上，再盖黄沙，让种球不与外界空气接触。这种方法保存种球会自我调节，减弱了呼吸作用，减少养分消耗的同时调节空气湿度。不与外界接触也可以减少病原菌的侵害。黄沙保存容易发热，注意通风控制湿度与温度。第二年春天可以栽种。
百合
如果需要大量贮藏，可以在容器底部铺一层细沙，放上种球，在铺沙子，种球，层叠起来放入阴凉的地方保存
