人工繁殖获得的匙吻鲟受精卵、鱼苗，除了留养一部分外，大部分要外售，有的还远销国外。由于匙吻鲟鱼苗一开口，必须及时吃到饵料，否则就很快死亡；同时，在同一尾匙吻鲟亲鱼取的受精卵，孵化出鱼苗时间的长短并不一样，最早与最迟的时间间隔相差长达10小时以上。因而运输刚孵出而没有开口的鱼苗，以当日运抵目的地为宜。一般提倡运输受精卵，而不提倡运输鱼苗。在运输受精卵时，必须掌握受精卵孵化至鱼苗出膜的时间，以便控制仔鱼在出膜之前运抵目的地。只要仔鱼没有出膜，受精卵中无死卵或很少死卵，水质就不容易变坏，受精卵运输的成活率就高。如果受精卵在运输途中已孵出了仔鱼，残留的卵膜很快腐烂，使盛鱼袋内的水质在短时间内变坏，在水温25℃以上，经1个多小时的运输，盛鱼袋中的水质就会变坏，袋内的受精卵和鱼苗会大量死亡，直至全部死亡。运输受精卵和鱼苗的距离，在400公里之内，运输时间不超过5小时，一般采用汽车装运；如果长途运输，则要通过飞机装运。
1.运输前的准备在运输受精卵、鱼苗之前，要准备好足够的包装箱、塑料袋、结实的橡皮圈或橡皮封口圈，还要准备干净的水、冰块和其他需要的用具，如盆、桶、捞网、计数器具等。要提前检查氧气瓶中的氧气是否充足。预计装箱需要的时间。如果用飞机装运，必须保证在飞机起飞之前2小时到达机场，以便办理托运手续等，避免贻误航班。
2.运输受精卵、鱼苗步骤
(1)放卵密度我国常用的放卵塑料袋规格为长90厘米、宽45厘米。每袋分别可装运受精卵7000粒或鱼苗3000尾。短距离运输，每袋分别可装运受精卵1万粒或鱼苗5000尾。
(2)计数鱼卵计数，采用重量计数法和容量计数法等两种计数方法。
①重量计数法：即用1个小容器，先放入一些清水，称出容器和水的重量。接着用网布做成的小捞子，从孵化器中捞出一定数量的受精卵，再放入已称过重量的容器中，第二次称出重量。然后把第二次称出的重量，减去第一次称出的重量，即得出受精卵的重量。将鱼卵准确计数后，就可以求出每1克或每10克受精卵的数量。重复2-3次，求出每1克受精卵或每10克受精卵的平均个数。以每克重受精卵的粒数或每10克重受精卵的粒数，即可推算出每个塑料袋可盛放受精卵的数量。
②容量计数法：即用5毫升刻度杯子盛放鱼卵3毫升、4毫升、5毫升，将鱼卵计数后，求得每毫升受精卵的个数。再重复2-3次，求出每毫升受精卵的平均个数。从每毫升受精卵的个数，再推算出每个塑料袋可装载受精卵的数量。
鱼苗过数的方法与受精卵过数的方法不同，鱼苗必须采用带水过数，否则将会导致死亡。
(3)充氧、包装要用双层塑料袋包装、运输。先将两个大小一样的塑料袋整齐地套在一起，在内袋中，注入清水约10千克，将已计数的鱼卵或鱼苗缓缓地倒入袋中，先将袋内空气挤出，再把充氧的气管插入袋中的水里，打开氧气瓶阀门，进行充氧。待袋内的氧气充到一定程度后，迅速抽出克氧管，用双手将内、外袋口分别用结实的橡皮圈扎紧，不让袋内的氧气外逸。将充了氧气的盛鱼袋平放在包装箱中，用胶布封箱和打包，装上汽车运往机场或直接运往目的地。在炎热的夏天，塑料袋内的氧气不能充得太足，在箱内要放置干冰或冰块降温，以防水质变化以及袋内气体遇热膨胀而炸裂。
3.运输途中的管理将已经包装好的受精卵、鱼苗箱运到机场后，在搬下车时，要注意轻放，必须放置在室内待运，切忌放在阳光下曝晒。应避免塑料袋内水温增高，保持袋内水质良好。抵达目的地后，要尽快分别将装箱的受精卵、鱼苗从货仓中提出运回孵化场或育苗场。使用汽车运输，2-3小时后，可抽箱检查一次，观察袋内的氧气是否足够，水质有无变化，受精卵、鱼苗的成活情况等。一旦发现袋内的氧气不足或水质已有变化，需要及时寻找适合的场所，进行换水和重新充氧，避免受精卵和鱼苗在运输途中受到损失。
