近年来，免疫鸡群或非免疫鸡群发生法氏囊病现象，且鸡群继发或并发球虫、大肠杆菌等病，使鸡的死亡率大大提高。
一是免疫程序混乱，有的鸡群7日龄就用法氏囊疫苗首免（一般14日龄用），有的18日龄首免，有的14日龄首免后因各种原因就没再加强免疫；二是禽舍消毒不严，病毒长期存在，形成多批鸡相继发病；三是不同日龄的鸡只混养，导致该病流行，多次发生；四是疫苗不是由主渠道供应，而是由饲料、兽药经营厂家销货“捎代”，疫苗质量不能保证；五是疫苗使用过程不规范，没起到防疫效果等。
防治措施：一是实行“全进全出制”，不同日龄的鸡不能混养。二是加强饲养管理，定期严格防疫消毒。三是制定合理的免疫程序，有条件的鸡场可用琼脂扩散法检测1日龄鸡母源抗体阳性率来确定首免日龄，最好使用活苗和油苗共用的方法进行免疫。四是用抗生素和肾肿灵配合饮水，以消除肾肿症状及预防继发感染，同时最好用一些调节机体免疫机能的药物，如黄芪多糖、白细胞介素等恢复免疫功能。
