致病生物对水蛭的侵袭
一些水蛭的疾病是由于致病的生物传染或侵袭到蛭体上而引起的，这些致病生物称为病原体。能引起水蛭生病的病原体主要包括真菌、病毒、细菌、霉菌、藻类、原生动物以及蠕虫和甲壳动物等，这些病原体是影响水蛭健康的罪魁祸首。
例如水蛭发生的白点病就是由小瓜虫寄生在水蛭体表上而发生的。
另外一些动物类敌害生物如老鼠、水蛇也会捕杀水蛭，有时也能将一些疾病直接传染给水蛭，有时也会将水蛭咬伤，而这些伤口也是其他病原菌侵入蛭体的通道，会引起水蛭的继发性疾病。
温度不稳定
水蛭是冷血动物，体温随外界环境尤其是水体的水温变化而发生改变，所以说对水蛭的生活有直接影响的主要温度。当气温过低或昼夜温差较大，或者是当水温发生急剧性变化，如水温突然上升和下降时，水蛭的机体和体温由于适应能力不强，不能正常随之变化，就会发生病理反应，导致抵抗力降低而患病。
例如在寒冷时未及时采取降温防暑措施，导致水温过高，造成水蛭食欲减退，甚至死亡。在水蛭亲本进入温棚进行保种越冬时，进温室前后的水的温差不能相差过大而导致水蛭发生应激反应，甚至大批死亡。
水质不好
水蛭生活在水环境中，水质的好坏直接关系到水蛭的生长，好的水环境发生变化，就可能不利于水蛭的生长发育，当水蛭的机体适应能力逐渐衰退而不能适应环境时，就会失去抵御病原体侵袭的能力，导致疾病的发生。
例如在水蛭生长旺盛时期，如果不及时换水，池水就会腐败，严重时发黑发臭，有害病菌大量繁殖，极可能引发各种传染性疾病。
水蛭自身的体质弱
水蛭自身体质的好坏也是抵御外来病原菌的重要因素，一尾自身健康的水蛭能有效的预防部分水蛭疾病的发生。水蛭对外界疾病的反应能力及抵抗能力随年龄、身体健康状况、营养、大小等的改变而不同。
例如当水蛭的身体一旦不小心受伤，又没有对伤口进行及时消炎处理时，病原体就会乘虚而入，导致各类疾病的发生。
密度过大
水蛭放养密度不当和混养比例不合理，都会导致疾病的发生。水蛭的养殖密度，一般和外界温度有关，温度低时，密度可适当增大些，温度高时，密度可适当小些，如果放养密度过高，必然造成水蛭活动空间相对减小，水体溶解氧减少，再加上饵料不足或分配不均，排泄物过多，有可能发生互相残杀，或引起疾病的发生和蔓延。另外在集约式养殖条件下，高密度放养已造成水质二次污染、病原传播，加上饲养管理不当等，都为病害的扩大和蔓延创造了有利条件。
营养不良
造成营养不良的原因：一是养殖密度过大，饵料分配不均，使弱者更弱，而逐渐消瘦体质下降，感染疾病或死亡；二是饵料营养配比不合理，投喂不当、或饥或饱及长期投喂单一饲料、饲料营养成分不足、缺乏动物性饵料和合理的蛋白质、维生素、微量元素等，这样导致水蛭摄食不正常，就会缺乏营养，造成体质衰弱，就容易感染患病；三是投饵不遵循“四定”和“三看”原则，水蛭时饥时饱，有时吃了不清洁或腐败变质的食物，也会造成发病或死亡。
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