受精率高低，水质条件好坏，能否及时清除死卵死胎和死苗，将直接影响到孵化率。因此，在生产性孵化过程中必须做好以下各点：
1．操作动作要轻：防止损伤鱼卵。操作处理鱼卵时，用盆、瓢、碗等带水移动。
2．保持水质清新：使水体维持嫩绿色为好，使水中含有适量的浮游植物。止水式孵化每天要换去水体的1/3～1/2，最好采取边排边进的方式，保持原来的水位。进排水速度缓慢些，防止进水过急而冲击振动受精卵而影响胚胎发育。微流水孵化同样进水速度要慢，每天坚持排污，水面污物一般采用捞海捞，底层污物用虹吸管吸。鱼苗出膜后要及时清除卵膜，防止卵膜沉积腐败而引起水质恶化。
在孵化池或留在原产卵池中孵化的卵，一般每天应换水一次，排除一部分旧水，注入一部分新水，并保持原水位。值得注意的是，孵出开始后，不宜过多换水，以避免水温变动过大，使鱼苗不适应而患病。一般仔鱼孵出当天，孵化池换水量占总水量的60％～70％；第2天到第5天，换水量可占80％。
3．控制水霉病发生：在鱼卵孵化期间，控制水霉菌感染是极为重要的。在最适孵化水温时，也是水霉病高发期。一般未受精的坏卵约10多小时就呈白色，必须及时用人工剔除死卵或发霉卵。在孵化过程中发生水霉病时，如感染数量少，可将病卵捞除；如发白的坏卵占多数，感染数量多，危害大时，已能向下转游。
可用0.1毫克/升的亚甲基兰消毒鱼卵，或根据孵化器水量，用浓度为1/15万～1/20万的亚甲基兰泼洒治疗，间隔6小时再泼洒1～2次。为预防水霉菌发生，受精卵放入孵化池之前24小时，每立方米池水可用0.1克左右的亚甲基兰进行池水消毒。孵化中至出膜前再施用2次亚甲基兰（浓度较第一次略淡）。孵化工具与设备也要事先用亚甲基兰消毒，消毒后待24小时后再使用，并注意保持清洁。
4．防止水温突变：换水时换入的新水和池内的水温不宜温差过大，一般控制换水后孵化池的温差不超过2℃。为此，刚孵出的鱼苗池不宜换水量过大；孵化设施最好加盖遮荫棚，防止太阳直晒和阵雨注入，致使池水温差剧变以及雨点打击受精卵。
5．防止缺氧：孵化水体缺氧的主要原因是由于孵化用水中有机物过多，这些有机物腐败时，致使有机耗氧量大而导致缺氧。孵化用水中有机物来源于水源本身以及孵化过程中死亡卵、死亡胚胎及死亡鱼苗没有及时捞除产生腐败形成的。有时因使用缺氧的地下水未经曝气就注入孵化池。另外，由于乌鳢卵中存在油球，当这些卵由于各种原因破裂时，这些油球便会释放到水中形成孵化水表面一层薄薄油封，加上受精卵孵化过程中，胚胎发育耗氧量特别大，这样便会导致水体缺氧。孵化水体缺氧不仅影响孵化，而且会更增加死胚，加上管理时未将这些死卵死胚及时捞除而发生腐败破裂，油滴释出，更加剧了水体因油封和有机耗氧增大的缺氧，形成恶性循环。所以在管理中不仅要捞除水体污染物，而且要在死卵死胚破裂前及时捞出，避免其放出油滴。同时，换水时注意轻轻换出表层中含油封的水层，操作过程要轻快，避免卵子破裂。
