天然湖泊都有它的形成、发展和老化的演替过程。所有各类不同的养鱼湖泊自然条件差异较大。有的湖泊已发展到浅化或沼泽化阶段，其自然条件较差，要经过改造以后才能提高渔业生产力。有的湖泊鱼产量虽已超过750千克/亩或更高，如能进一步改善其渔业生产条件，鲜鱼产量会更高。因此，特别是在湖泊综合养鱼生产上要十分重视自然条件的改造。改造湖泊自然环境，以适应发展综合养鱼的需求，主要应围绕三个方面工作去做:
（1）渔、农、牧生产区的划分和改造首先要依据湖泊自然条件，因湖制宜地制订出发展规划，根据规划执行湖区改造。有的湖泊只要利用原有自然条件，稍稍加以改造，就可利用水面养鱼；利用沿岸种植饲料作物或发展畜、禽饲养业。如往深度发展，可按面积比例划分成不同专业生产区域。例如水面可划分成深水区和浅水区；沿岸划分为饲料种植区和畜、禽饲养区。深水区养鱼，浅水区发展经济水生植物，如种植莲藕、菱角等。
（2）经济鱼类生活环境的改造鱼类生活环境的改造，主要是扩大有利于鱼类活动的水域，提高鱼类天然及人工饵料基础；以及合理地控制野杂鱼类。有的湖泊发展到老年期，大型水生植物面积扩大，形成草型湖泊，开始可以多放养草鱼控制水草，以腾出养鱼水面。有的湖泊已经沼泽化，也可结合农田水利建设进行改造，例如湖北省汉川的刁汊湖，原先已成荒湖，淤泥厚，经过综合治理和改革，全面安排灌溉、航运、绿化、养鱼，开挖深沟大渠，控制了水位和水面，为发展养鱼创造了有利条件。为了繁殖鱼类的天然饵料，有的就利用沿岸饲养畜、禽，还可移植一些底栖生物类的天然饵料。适当地清除凶猛鱼类，可提高放养鱼种的成活率。
（3）鱼类繁殖条件的改良主要包括天然产卵场的保护和改造以及人工产卵场的建造等工作，以保持和提高经济鱼类自然再生产能力。
