随着气温的逐渐降低，大部分浸染花卉苗木的病虫害将以各种方式进入越冬休眠状态。这一时期各种病虫基本上不活动或移动性很小，正是防治的有利时机。实践证明，冬季防治的成效直接关系到翌年病虫的发生状况，如果措施得力，可大大降低来年病虫的发生及危害程度。同时，还可最大限度地降低化学农药的使用量。
清理苗圃大多数花卉苗木病虫的病原菌或越冬虫卵，均在苗圃内的枯枝落叶或杂草中越冬，待来年条件适宜时再出来活动。因此，冬季将苗圃内的枯枝落叶和杂草彻底清除销毁，改善卫生状况，可以大大地减少各种病虫源。这对于防治月季、玫瑰、菊花、海棠及柳树等花木的炭疽病、白粉病、锈病、红蜘蛛、蛾类等具有显著效果。
剪除带病虫枝叶冬季修剪是苗圃管理的重要环节之一。结合冬季修剪，着重剪除带病虫的枝叶，如月季、玫瑰等花木上的虫卵，杨、柳及花灌木上的介壳虫等，剪下的病虫枝叶要及时清理，运出苗圃集中销毁。
冬耕深翻冬耕深翻可以使潜伏在土壤中的地下害虫如蛴螬、地老虎、蝼蛄等的幼虫、蛹、卵等遭受机械损伤，暴露在地表后又可以使其被鸟类等天敌啄食，必要时还可采取人工捕杀。另外，深翻可以将土壤表层的病原物翻埋入深土层，深土层中的病原物被翻到地面，破坏了病虫的适生环境，有效地控制了病虫的发生。
涂白保护枝干涂白不仅能有效地防止冬季花木的冻害，提高花木的抗病能力，而且还能破坏病虫的越冬场所，起到既防冻又杀虫的双重作用。特别是对在树皮里越冬的螨类、介壳虫等作用更佳。要特别注意的是生石灰一定要充分消解，否则涂到花木枝干上易造成烧伤。
药物防治由于冬季各种病虫多处于休眠状态，对那些在发生季节不易防治的病虫可以采用药物防治。如用机油乳剂50～100倍液可喷雾防治介壳虫，晚冬喷施1%的波尔多液2～3次能对梨锈病、月季黑斑病等多种病害起到良好的防治作用。
