1、角斑病
该病会造成哈密瓜子叶呈黄褐至黑褐色坏死干枯，成株叶片感染后，会出现浅黄色斑，后期破裂穿孔，并溢出乳白色菌液，果实受害后，会出现油渍状黄绿色小斑点，后期病部凹陷龟裂，并出现白色菌脓。
防治方法：加强田间管理，注意水肥施入，能够提高哈密瓜的抗病能力，避免施入过多氮肥，及时补充硼钙肥，增加叶片厚度，以保花保果，另外还要注意排水，降低棚内湿度。
2、酸腐病
此病主要发生在半成熟至成熟瓜上，病瓜初期成水渍状，以后软腐，在其表面产生一层致密的白色霉层，以后呈颗粒状，散发酸臭味。严重时可造成大批瓜果腐烂。
防治方法：收获后彻底清除病残瓜，并进行销毁，减少田间病源传播，并加强中后期管理，适时浇水施肥，并喷施新高脂膜600倍液，提高哈密瓜的抗病能力，用药的时候要注意均匀，这样能够明显提高药效。
3、蔓枯病
该病主要危害叶片和果实，茎蔓染病多在茎节处形成水浸状青色病斑，后期会变为红褐色不规则坏死斑，叶柄染病，呈水浸状腐烂，造成植株干缩倒伏。果实受害后，会出现褐色水浸状病斑，后期呈星状破裂，引起甜瓜腐烂。
防治方法：可以实行与非瓜类作物轮作，这样通过深翻土壤，可以减少病源，充分施入磷钾肥和底肥，并及时整枝、打杈、疏果、打顶，保持园内通风透光，发生病害后，可以使用70%代森锰锌或75%百菌清可湿性粉剂600倍液进行叶面喷施，防治效果非常不错。
