矮化密植果树应减少骨干枝的数量，增加枝组的比例，大都在中心干和主枝上直接培养枝组。
由于矮化密植果树进入大量结果时间较早，所以应该较早地注意树体生长和结果之间的关系。保证矮化密植果树每年有一定的正常生长量，以保持健壮的生长状态，掌握未衰先更新的原则，利用健壮的发育枝更新树冠，稳定骨架，维持骨干枝的生长优势。
在更新树冠的同时，进行枝组的及时更新，以防止结果枝的衰弱。因此，枝组内要合理分工，留预备枝，控制花量。花芽过多的老枝应重短截以促进分枝，过密时可适当疏去。矮化砧上的果树一般容易出现腋花芽，增大了花量，为了节约养分，延迟树体衰弱，根据具体条件，应利用或控制腋花芽的数量。
从幼树结果开始，应适当重剪，培养离骨干枝较近的紧凑枝组。
矮化密植果树应重视夏季修剪，特别是利用乔砧采取矮化技术使树体矮化的果园，更应该利用夏剪控制树势，培养枝组。通常用调节骨干枝角度以控制树势，用环割后涂抹促花王阳离子活性剂来促进花芽形成，促使果树早结果，延长盛果期。用拿枝、弯枝、扭梢等方法控制生长，缓和有关枝条的生长势。用疏剪的方法，改善光照，减少消耗，有利于花芽形成，提高坐果率和增进果实品质。用短剪、摘心等方法，控制旺枝，促进分枝，加速培养枝组，以达到早果、丰产、优质的目的。切记，对于修剪所造成的剪锯创伤口要及时涂抹油质软膏愈伤防腐膜来消毒杀菌，以防雨水污染，阻碍伤口组织生长，进而导致大量气传性病菌和病毒从伤口侵入树体内，诱发果树腐烂等多种病害。
