从理论和经验两方面都说明，果树秋施肥比春施肥好，秋冬时节早施肥比晚施肥好。
以苹果树为例在果实采摘后，及时施用摘果肥有利于果园来年的持续增产。由于果树的根系是养分吸收与贮藏的器官，第二年春季生长发育所需的养分多来源于根系的贮藏，可以说根系贮藏养分的水平决定着来年花芽分化的质量，也决定果树的抗寒性等性状。一般处于地下的果树根系没有自然休眠，只要条件适宜，全年根系都可发生及生长，而且在9月，不同果树将先后出现根系生长的高峰期。如果今年果实丰产、地上部负荷过大，但是秋天不及时施肥，根系营养跟不上，甚至不生长秋根，那会严重影响越冬和春季发根。因为早春根系生长所需要的养分主要是贮藏营养，如果头年秋季错过了摘果肥，造成贮藏营养不足，必定要减少春季发根和发芽。
以氮肥为例不同的施氮时期对果树的生长发育有不同的影响。对苹果而言秋施氮肥，即使施氮量小于春施量，但第二年开花坐果的效果还是非常明显的。因为从采收到落叶是氮素营养贮备期，此期氮含量的高低对翌年优质花芽的分化和创高产都起着重要作用。当然秋施肥除了氮肥以外，磷钾肥也同样重要。供磷充足能使果树如期完成枝条生长阶段，促进花芽分化，提高坐果率，而且磷对氮素营养有调节作用；此外，果树需钾量大，增施钾肥能促进果实增大，增加果实单果重。
