设施桃树栽培，环境相对密闭，并可对多种生态因素进行人为调节，因此各种病虫害的发生与传播可受到有效控制，但仍不能忽视少量病虫害的发生。常见的病害有细菌性穿孔病、炭疽病、褐斑病；害虫有桃蚜、红蜘蛛等。
主要病害
穿孔病分为细菌性穿孔病、褐斑穿孔病、霉斑穿孔病等。叶、果、枝梢均可发病，叶片发病形成斑点，以后病斑干枯形成穿孔，严重时引起早期落叶。
防治方法一是结合修剪及时剪除病枝，清除病叶。二是花芽膨大期喷施3～5波美度石硫合剂，落花后喷施农用链霉素，展叶后至发病前喷施代森锌、苯菌灵等防治。
桃炭疽病该病主要危害果实，也可危害叶片和新梢。幼果于硬核前开始染病，病斑红褐色，中间凹陷。被害果除少数残留于枝梢外，绝大多数脱落。成熟期果实发病，病斑凹陷，具明显的同心环纹和粉红色稠状分泌物，并常融合成不规则大斑，最后果实软腐，多数脱落。桃品种间的抗病性有很大差异，早熟、中熟品种发病较重，晚熟品种发病较轻。开花及幼果期低温、潮湿易发病。
防治方法一是清除僵果、病果、病枝、病叶。二是萌芽前喷3～5波美度石流合剂，花前和落花后喷甲基硫菌灵、多菌灵、代森锰锌等药剂防治。
桃褐腐病桃褐腐病危害桃树的花、叶、枝梢及果实，以果实受害最重。开花期及幼果期低温高湿，果实成熟期温暖高湿发病严重。树势衰弱、管理不良和土壤积水或枝叶过于茂密，通风透光差的果园发病较重。
防治方法一是结合修剪做好清园工作，彻底清除病果、病枝，集中烧毁。二是及时防治害虫，减少虫害和虫伤。三是发芽前喷3～5波美度石硫合剂，落花后10～15天喷代森锌、甲基硫菌灵。褐腐病发生严重的果园，可在花前、花后各喷1次腐霉利或苯菌灵。
主要害虫
蚜虫为害桃树的蚜虫主要有桃蚜、桃粉蚜和桃瘤蚜3种。蚜虫1年发生10~20代。新梢展叶后开始为害，有些在盛花期为害花器，刺吸子房，影响坐果。
防治方法桃蚜对白色和黄色有趋性，可设置黄色器皿或挂黄色黏胶板诱杀。萌芽期和虫害发生期，除施用烟雾剂外，还可喷吡虫啉、苦参碱、烟碱乳油等防治。
桃小食心虫该虫以幼虫蛀果为害。幼虫孵化后蛀入果实，蛀果孔常有流胶点。幼虫在果内串食果肉，形成“豆沙果”，并在果实上留蛀果孔。
防治方法一是成虫羽化前，在树冠下覆盖地膜，以阻止成虫羽化后飞出。二是成虫羽化出土前翻树盘并用杀虫剂处理土壤，杀死羽化成虫。三是在成虫羽化产卵和幼虫孵化期及时喷药，可喷灭幼脲、杀铃脲等药剂。
螨类螨类主要有山楂红蜘蛛和二斑叶螨，以幼螨、成螨群集在叶背取食和繁殖。严重时造成大量落叶，影响花芽分化。
防治方法可在桃树发芽前喷3～5波美度石硫合剂，发生时喷阿维菌素、苦参碱、浏阳霉素等防治。
