随着气温逐渐降低及可能持续的阴雨天气，是病虫害易发时机。防范菌核病等油菜高发病，是确保油菜籽产量和品质的关键。
针对油菜病害中发病较高的菌核病，采用“以菌治菌”方式，通过应用盾壳霉早期配合葡萄糖（为盾壳霉繁殖提供营养）喷雾，在土壤中繁殖形成菌群，对菌核和萌发的菌丝等寄生侵染，从而使其丧失活力，达到生物防控油菜菌核病的目的。
除杂草方面，主要采用封杀结合的方式。一是油菜越冬前喷施金都尔，在土壤表层形成药膜，禾本科杂草种子萌发时通过胚轴和芽吸收中毒死亡，达到封闭除草效果；二是油菜苗期，对繁缕等阔叶杂草在幼苗期喷施保顺，通过茎叶吸收传导后死亡，从而达到除草目的。两类药剂可以根据不同栽播方式单用或配合使用，防除效果都很好。
同时，针对农田鼠类的生活习性，可采用两种灭鼠方式。一种是毒饵站灭鼠，将拌匀的毒饵放置在内部，结合鼠类沿沟渠和田埂活动的规律，将毒饵站安放在相应位置，鼠类取食后逐步中毒死亡，加之毒饵站的长度30厘米以上，直径5厘米左右，配合抗凝血类杀鼠剂（多次取食并达到摄入量后死亡）使用，可有效避免其他野生动物和家禽等误食。另一种是围栏陷阱捕鼠法，顾名思义，通过设置围栏阻挡鼠类活动通道，同时每隔5米埋放捕鼠桶（陷阱），并且预留通道，鼠类活动时掉入陷阱后进行灭杀和处置，可以完全不使用杀鼠剂，绿色环保。
