整枝摘心是甜瓜管理重要的技术措施，是栽培成败的关键。因为甜瓜主蔓生长较弱，侧蔓的长势却十分旺盛，且薄皮甜瓜一般以子蔓、孙蔓结果为主，为调节甜瓜茎蔓的生长，生产上常采用摘心、整枝、打杈等技术，控制茎蔓的营养生长，促使早结瓜、早成熟。生产上瓜农可采取以下三种方法进行整枝。
双蔓整枝：适用于温室、大棚甜瓜吊蔓栽培。主要方法是：主蔓二叶一心至三叶一心时掐尖，在下部留两条健壮子蔓吊起，每条子蔓上每留一个瓜，瓜前选留两条侧枝(孙蔓)，每个孙蔓上留三片叶摘心，保证平均有7～9片功能叶促进果实发育。每个子蔓上最多可留4个瓜，全株可留瓜8个。
三蔓整枝：适用于露地及保护地不吊蔓栽培形式。主要方法是：主茎三叶一心至四叶一心时掐尖，每株留三条健壮子蔓，第一条子蔓可在第三个叶片处留一瓜，第二条子蔓在第二个叶片处留瓜，第三条主蔓可在第一叶片处留瓜。每个子蔓上留3～4个孙蔓，每个孙蔓上留3个叶片后摘心，全株留3个瓜，果实成熟与上市比较集中。全株有叶片50多片，平均每个瓜有17～20片功能叶片，保证叶片光合产物满足膨瓜及糖分积累，促进果实正常的生长发育。
四蔓整枝：适用于露地及保护地不吊蔓栽培形式，主要特点同三蔓整枝。方法是：主茎四叶一心至五叶一心时掐尖，每株留四条健壮子蔓，第一条子蔓可在第四个叶片处留1个瓜，第二条子蔓在第三个叶片处留瓜，第三条主蔓可在第二叶片处留瓜，第四条子蔓在第一叶片处留瓜。每个子蔓上留3～4个孙蔓，每个孙蔓上留3个叶片后摘心，全株留4个瓜。
注意事项：整枝应选择晴天露水蒸发后进行，以利伤口尽快愈合，防止感染。整枝最好用剪刀，并且准备一块浸有75%百菌清200倍液等药剂的湿润药巾，剪完一棵擦一次剪刀，以防交叉感染。
