生态防控果园腐烂病应从加强果园综合管理入手，以增强树势为根本，以农业、物理和生物措施为基础，以药剂控制为手段，坚持预防为主，综合防治。
灰铜油高锰酸钾防治法硫酸铜1公斤、生石灰2公斤、适量高锰酸钾和动物油8克，把0.1%的高锰酸钾放入机油中搅拌均匀，再依次加入生石灰、硫酸铜混合即可。每年的10～12月份或次年的3～4月，用快刀将果树主干或主干上带病疤的皮全部刮掉，深达木质部，并把周围的好皮斜向刮掉1～2厘米,切面要光滑干净，然后把配好的灰铜油高锰酸钾药剂涂抹在刮好的病疤上，涂抹的范围应超过病疤周围2厘米以上。要求做到刮一块涂一块，过2周再涂抹一次。
蒜液杀菌法将大蒜捣成蒜泥，按1：1的比例加入10%的食盐水制成蒜液。使用时先将病疤刮净，用小刷子将其涂抹在病疤上，周围应超出2～3公分。10天后再涂抹一次。
尿液淋涂法先将病疤刮净，然后用放1周的陈尿淋涂到病疤处，周围超出2～3公分，10天后再涂抹1次。
食盐水防治法首先将煮制盐水，将食盐按25%的比例配成盐水，放到锅里煮开，晾凉备用。使用时先将病疤刮净，用刷子将盐水涂抹在病疤上，以浸入到树皮内，起到杀菌作用。10天后再涂抹1次。
石硫合剂防治法用石硫合剂原液或石硫合剂渣，使用先将病疤刮净，切面要干净广滑用刷子蘸取石硫合剂原液或渣，涂抹病疤，超出病疤2～4公分，1月后再涂抹1次，治愈率在98%以上。
碱水浸泡法将食用碱面和水按1：5的比例配制碱液。将病疤刮净，用刷子将碱水充分涂抹在病疤上，周围超出2～3公分，使碱液能够充分浸入树皮内，1周后再进行1次。
敷泥防治法取新鲜泥土用清水拌匀，泥土最好在远离果树的地方取用，泥土湿润程度以捏成泥团能粘附在树皮即可，涂抹厚度为5公分，然后用塑料薄膜包扎，不要透气，以防水分蒸发和泥脱落。1年后，将塑膜和泥土去除，这样好气病菌因长期没有氧气就会窒息而死，此法治愈效果非常好。
