根腐病。夏季高温多湿，低洼积水的地块，常发生此病。根腐病主要危害根部，使根部分或全部变色腐烂，茎、叶因根无法供应水分而下垂、干枯。选排水良好的地块轮作，翻晒土壤，发病初期用50%石灰水浇根或用1%硫酸亚铁消毒，可以防治根腐病。
叶斑病。高温、多湿、田间通风不良、植株生长衰弱时发生较多。它主要在叶上形成黄褐色或紫色，各种形状的斑点，后期病斑扩大互相连接成片。严重受害的，叶片干枯脱落。轮作，对种子或种苗用多菌灵或代森锰锌600-1000倍液消毒，可防治该病。
立枯病。阴湿地块的药材早春遇低温，施未充分腐熟的肥料易发立枯病。幼苗发病较多，染病后，在贴近土表处幼茎基部出现黄褐色病斑或基部全部变色、干枯，上部枝叶枯黄倒伏而死亡。轮作，种植密度合理，在立枯病发病初期用退菌特可湿性粉剂1000倍液或代森锰锌70%胶干粉300-350倍液喷雾，或拌细土撒于茎基部，可防治立枯病。
锈病。多雨、多雾季节，土壤潮湿、植株生长柔嫩的田块易发此病。发病时，茎叶上出现黄色或深褐色圆形或长圆形病斑，后期病斑鼓起，表皮破裂飞散出黄色或褐色粉末，病斑处破裂穿孔，叶片枯死。开沟排水，防止田间积水，发病初期喷97%敌锈钠400倍液或波美0.30度硫合剂，早期清除病株病叶，可防治锈病。
黑粉病。茎、叶、穗均可感病。发病株茎叶弯曲、畸形，形成小瘤状，外面有层白膜，后期破裂，散出黑粉。穗感此病，则不结籽。轮作，种子消毒，早期拔除病株，收获后清田，可防治黑粉病。
菌核病。多发生在土壤潮湿、温度低的地块。根茎叶均可感病。发病后，茎叶发软，根系腐烂，植株倒伏。湿度大时，病部发生很多棉絮状的白绒毛，后期形成黑色鼠粪状的菌核。轮作，雨后排除田间积水，拔除病株，用草木灰、石灰粉撒入病穴消毒，用退菌特600倍液喷雾，可防治菌核病。
