冬季棚室中温差大、湿度高、多雾气的环境，加上重茬、连作、施用不腐熟肥料的影响，棚室茄子黄萎病、绵疫病、灰霉病等病害往往发生较重，菜农应注意防治。
一、黄萎病
茄子黄萎病一般在开花、门茄结果初期发病，苗期较少发病。一般先从中下部叶片开始发病，发病初期植株下部叶片中午萎蔫，早晨和晚上能恢复，反复几天之后不再复原。感病植株初期发病先表现为下部或一侧部分叶片、侧枝中午呈萎蔫状，看似因蒸腾脱水，晚上恢复原状态，故俗称“半边疯”。切开根、主茎、侧枝和叶柄，可见到维管束变黄褐色或棕褐色。而后萎蔫部位或叶片不断扩大增多，逐步遍及全株致使整株萎蔫枯死。湿度大时感病茎秆表面生有灰白色霉状物。
防治方法：定植时可选用10亿芽孢/克枯草芽孢杆菌可湿性粉剂(萎菌净)1000倍药液灌穴，每株灌250毫升，如果在门茄瞪眼期再灌根1次效果会更好；也可选用75%百菌清(达科宁)可湿性粉剂800倍液、2.5%咯菌腈(适乐时)悬浮剂1500倍液、80%代森锰锌(大生)可湿性粉剂600倍液或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液灌根，每株灌250毫升，在生长发育期、开花结果初期、门茄瞪眼时连续灌根。早防早治效果会很明显。
二、绵疫病
该病主要危害即将成熟的茄子，造成烂茄。近地面果实先发病，受害果初现水渍状圆斑，稍有凹陷，之后很快扩大直至整个果实受害，病部黄褐色，果肉变黑褐色腐烂，湿度大时受害果易脱落，果面密生白色棉絮状菌丝，有臭味。
防治方法：预防可以选用25%双炔酰菌胺(瑞凡)悬浮剂1000倍液、75%百菌清(达科宁)可湿性粉剂600倍液、25%嘧菌酯(阿米西达)悬浮剂1500倍液或80%代森锰锌(大生)可湿性粉剂500倍液等药剂喷施。治疗药剂可用68%精甲霜灵·锰锌(金雷)水分散粒剂600倍液、25%双炔酰菌胺(瑞凡)悬浮剂800倍液加25%嘧菌酯(阿米西达)悬浮剂1500倍液、50%烯酰吗啉·锰锌(安克)可湿性粉剂600倍液或72.2%霜霉威(普力克)水剂800倍液等喷施。茎基部感病可用68%精甲霜灵·锰锌(金雷)水分散粒剂500倍液喷淋或涂抹病部，尤其是感病植株茎秆以涂抹病部效果更好。
三、灰霉病
该病主要危害茄子幼果和叶片。感病叶片呈典型的“V”字形病斑。花期侵染病菌从开花后的雌花花瓣侵入，使花瓣腐烂。果蒂顶端开始发病，果蒂感病向内扩展，致使感病幼瓜呈灰白色，软腐，长出大量灰绿色霉菌层。
防治方法：因茄子灰霉病是花期侵染，茄子蘸花时的药剂预防作用就非常重要。其配药方法是：将配好的蘸花药液中加入1%的50%嘧菌环胺(和瑞)水分散粒剂或40%嘧霉胺(施佳乐)悬浮剂、50%农利灵干悬浮剂等进行蘸花或涂抹，使花器均匀着药。也可单一用果霉宁、丰产素2号等药液喷花或浸花。果实膨大期要进行重点喷雾防治。单独防治灰霉病时可选用25%嘧菌酯(阿米西达)悬浮剂1500倍液、75%百菌清(达科宁)可湿性粉剂600倍液、50%嘧菌环胺(和瑞)水分散粒剂1200倍液、50%农利灵干悬浮剂1000倍液或40%嘧霉胺(施佳乐)悬浮剂1200倍液等喷雾。
