一、底肥施用均衡且充足
底肥以有机肥为主，特别是土壤存在有机质含量不高、板结、重茬、盐渍化等问题的大棚，更要适当增施有机肥。从有机肥定义的功能来看，有机肥应在施入土壤后可以提高土壤活性，提高化肥利用率，利于土壤团粒结构的形成，给作物补充钙、镁、钾、硅、锌等必需的营养元素，显著减轻土传病虫害和连作障碍。建议施用优质的、有机质含量50%-85%的成品生物有机肥，尽量少用或不用含氮高、含火碱等消毒剂、有大量有害虫及卵的动物粪便。如果施用动物粪时，则应结合闷棚或秸秆还田充分腐熟时杀灭虫卵。在施好有机肥的基础上，施用适量的氮磷钾肥和中微量元素肥，建议每亩用磷酸二胺25千克—40千克，硫酸钾25千克左右或15-15-15或17-17-17平衡复合肥50千克—60千克，并且根据上茬作物的生长情况，施一部分钙、镁中量元素肥和硼、铁、锌等微量元素肥。
二、苗期施肥关键是养根
番茄苗定植后，一般从第二水开始冲肥，苗期养根很关键，尤其是早春茬苗正值低温时期。秋延迟茬苗恰遇高温期，这都不利于根系的生长，需要多加注意。此时，菜农可选用海藻酸、甲壳素、黄腐酸、生物菌类养根肥，水水带肥，养护好根系。
三、生长前期施肥平衡植株长势
在施足底肥的基础上，番茄生长前期施肥以养根、壮棵、促进花芽分化为主。如果植株生长正常，可用以上推荐的养根肥每亩加19-19-19或20-20-20的平衡水溶肥1.5千克—2.5千克进行冲施。如果植株偏弱，可用养根肥加平衡水溶肥1.5千克/亩—2.5千克/亩进行冲施，如果植株偏旺拔节长，可用养根肥加磷酸二氢钾2.5千克/亩—5千克/亩进行冲施。切不可盲目增加水溶肥用量，避免植株出现生长异常的情况。
四、生长中后期重在增产提质
一般根据不同地区番茄的留穗数量来计算生长中后期，整个生长季留5穗果的以授粉3穗，留6穗果的以授粉4穗果算起。由于番茄根系发达，在前期养好根系的基础上，中期可暂不冲养根肥或间隔养根，水溶肥以高钾肥为主，或高钾肥加少量平衡肥冲施，高钾水溶肥原则上钾的含量超过30，氮的含量根据植株长势决定。植株长势旺时，氮肥用量要低，建议含量为12-15。植株长势弱时，可以适当增加氮肥用量，建议含量为16-18，以免因为植株长势旺或本身土壤中含氮高，再用氮高的会引起番茄空心、着色不良、上色慢、颜色不正等现象。相反，如果植株长势不旺，再用含氮量少的肥料会使果实长不大，从而影响整体产量。番茄进入结果期后，菜农多会偏施钾肥，而钾高氮低也会使果实太硬，容易裂果。这种情况在生产中较为常见，应及早改正。
此外，当番茄上部果实膨大至1/3大小时，一般可以停用水溶肥，同时，后期植株挂果多且疏于管理后，根系易老化早衰，引起下部叶片或顶部叶片发黄，对此，菜农应注意加强养根工作。
五、叶面补肥不定期进行喷施
番茄叶面追肥虽然补充量较少，但利用率高，平时开花坐果期硼、钙、镁等中微量元素的补充，低温连阴天无法冲施情况下的追肥很有必要。另外结合喷药加含抗逆性的叶面肥也能养护好叶片，对促进根系生长，增加果实的商品性作用很大。根据番茄不同的生长阶段，不定期叶面喷施中微量元素，中量元素以10天—15天喷施一次，结合灌根施用时可适当延长间隔期。微量元素可20天—30天喷施一次，以叶面喷施为主。
