生产实践中侵染蔬菜作物的病原物主要有真菌、细菌和病毒三类。
真菌类病害由真菌侵染引起的蔬菜病害最多，如白粉病、霜霉病、疫病、灰霉病、晚疫病、炭疽病、叶斑病、菌核病、枯萎病、根腐病、茎腐病等等。对这一类病害的生物防治措施可冲施豆粕发酵液，具体做法是：黄豆粕10份加水20份加“申丰”菌液1份，在水缸或塑料桶内发酵，高温季节2-3周，低温季节3-4周，即可随浇水冲施，代替化肥。“申丰”菌液中的有益菌群以黄豆粕为培养基发酵后，成等比数列繁殖，菌群迅速壮大，施入土壤后，形成独立的菌群，抑制病原菌的繁殖，坚持连续冲施，可有效防治由土壤传播的真菌和细菌病害。
细菌性病害这类病害主要有软腐病、疮痂病、溃疡病、角斑病等。由土壤和种苗传播，需要早发现、早防治。生产中用来防治细菌性病害的杀菌剂主要是铜制剂，如可杀得三千（46%氢氧化铜水分散粒剂）、冠菌清（57.6%氢氧化铜水分散粒剂）。10点钟前用杀菌剂水溶液叶面喷洒。这两种铜制剂在使用时，要单独稀释喷洒，不可与其他农药混合使用，在黄瓜上慎用。
病毒病蔬菜病毒病主要是由花叶病毒感染。生产中，防治这一类病害在技术上难度很大，目前，还没有有效的治疗药剂，在防治这一类病害的实践中，可从两个方面着手。一是发病前叶面喷洒壮秧保护剂———吗胍乙酸铜水溶液。这一类保护剂在使用时，要单独稀释，单独喷洒，不可与其他农药混合使用，10点钟前喷洒效果更好。二是及时防治刺吸式口器害虫—蚜虫、白粉虱、蓟马、螨虫等等。发现有感染病毒的单株后，要及时连根拔除，使其远离农田，并在感染病毒的病株生长处填埋生石灰1-2公斤。
