不同品种的花椰菜耐贮藏的能力不同，只有选择耐贮藏品种，才能实现贮藏保鲜，获得可观的经济效益，目前耐贮藏的品种主要以中晚熟品种为主，早熟品种不宜贮藏。按品种生育期长短及当地适贮时期安排播种期，一般应比鲜食花椰菜适当晚播种、晚定植，使收获期赶在上冻之前，过早收获，气温高，不易贮藏；过晚易出现冻害，产量低。在栽培管理上，不要大水灌溉，应采用沟灌的方法，采收前7-10天少浇水或不浇水，花球生长中、后期进行外叶覆盖花球以保护花球不受日晒和冻害。在施适量氮肥基础上，增施磷钾肥。
适宜花椰菜贮藏的花球标准是：花球直径15厘米左右，重量在0.5-0.8千克的中等花球。花球致密，洁白，无虫害，无病毒，无损伤，无污染。
采收时，如打算进行2个月左右的短期贮藏，可留4-6片小叶保护花球，也利于维生素C的保存，若贮藏期超过2个月，应贮存不留叶的花球，因为在贮藏后期叶片易腐烂，使花球带有发霉味道，影响花球风味，从而失去食用价值。采收时，应避免花球受损，因为受损后的花球在贮藏中变黄变暗，出现褐斑及腐烂。
适宜花椰菜贮藏的温度为0-1℃，温度过高，特别是超过10℃时，容易引起花球变色、抽薹、失水萎缩和腐烂，失却了贮藏价值；低于0℃时，容易出现冻害，花球出现局部透明，回温后，即出现褐色斑点，影响花球的风味和贮藏。适宜花椰菜贮藏的相对湿度为90%-95%，湿度过低，花球易脱水萎缩疲软，花枝松散，失去商品价值和食用价值。
