中药材用种子繁育最为普遍。种子繁育技术简单，利于引种驯化和新品种培育。但是种子繁育的后代容易产生变异，开花结实较迟，尤其是木本中药材用种子繁育所需年限很长。所以中药材良种繁育，一是加速繁育新的优良品种，以便更换已在生产上应用的老品种；二是保持新品种的优良性状，防止混杂和退化。如元胡的块茎分母元胡和子元胡，生产上必须用子元胡作种才能优质高产。又如贝母，因繁育系数很低，为保证种子的质量，生产上常将商品贝母生产地和种子繁育地分开。
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