肥料是浮游生物生长的必不可缺少的物质基础,浮游生物又是滤水性养殖鱼类生长的主要饲料，所以，各种肥料对养殖水体的影响，也就等于对滤水性养殖鱼类的影响。要想养好滤水性鱼类，首先要了解各种肥料对养殖水体的影响。
肥料的种类有无机肥、有机肥和微生物肥，它们对养殖水体的影响分别是:
无机肥：肥效快，肥效短，引起水体中氨浓度快速增加，当气温高时，易引起氨中毒，导致一系列严重后果。
有机肥：肥效慢，肥效长，肥效稳定。粪便直接作肥料时会带入大量有害菌,使水质恶化。
微生物肥：单独使用时没有肥效。只有当水体中有机物多时才能通过分解有机物产生小分子物质，为浮游植物提供营养，达到肥水目的。
