波斯猫眼睛不一样是遗传所致，成为“鸳鸯眼”。并不是所有的波斯猫都是鸳鸯眼的，波斯猫鸳鸯眼都是杂交所致，一只眼睛为蓝色，一只眼睛为铜色。有鸳鸯眼的波斯猫多数都有遗传疾病，这种眼镜色彩的混搭也来之不易，因为两只双色眼睛波斯猫交配也不一定能保证剩下一窝双色眼睛幼猫。
为什么纯种波斯猫的俩眼睛却会是不同的颜色呢？
纯种的波斯猫眼睛的颜色都会是一样的，而有鸳鸯眼的波斯猫一般会被认为是杂种。波斯猫眼睛的颜色有蓝色、绿色、紫铜色、金色、琥珀色、怪色和鸳鸯眼。鸳鸯眼的波斯猫眼睛一只为蓝色，另一只为黄色。据研究发现，有鸳鸯眼的波斯猫其毛发的颜色为白色，而绿色、琥珀色及金色眼睛的猫，一般属于银灰毛色系。而且各种眼睛的颜色越纯，颜色越深就表示其品种越优质。
为什么波斯猫的眼睛一蓝一黄呢？
波斯猫的眼睛也不全是一蓝一黄的。这和遗传有关。\r以下内容从网上copy，我觉得可以作为答案\r首先并不是波斯猫的眼睛都是鸳鸯眼，鸳鸯眼的波斯猫多半是白毛，而且，最重要的是，鸳鸯眼的猫多半是杂种！（因为基因突变的概率很小，也可以说都是杂种）而且不是只有波斯猫有鸳鸯眼，其他猫也有。纯种猫的两只眼睛颜色是一样的，鸳鸯眼一般认为是杂种所致。这种猫（中国临清猫或土耳其安卡拉猫）多数有遗传缺陷，蓝眼睛非常漂亮，耳朵却是聋的。所以人们用黄眼睛白猫跟这种猫杂交，繁育出鸳鸯眼，一只黄、一只蓝眼睛的白色长毛猫，就没有耳聋的缺陷了。波斯猫眼色因毛色而定，一般认为波斯猫眼睛的颜色有蓝色、绿色、紫铜色、金色、琥珀色、怪色和两只眼睛具有不同颜色(即鸳鸯眼)。鸳鸯眼波斯猫的毛色常为白色。绿色、琥珀色及金色眼睛的猫，一般属于银灰毛色系。各种眼睛的颜色越纯、越深越好，并且以两只眼睛的颜色均匀为佳。
