深水网箱海水鱼类养殖所选择的海域水质一定要合适，表层水温8～28℃、溶解氧6毫克/升以上；pH7.8～8.6；透明度0.3米以上。网箱应设置在水流畅通、风浪较小的内湾，既要保证网箱中水体的交换量和溶解氧，又要保证网衣成固有的形状。海区流速一般在50～100厘米/秒左右，以免鱼顶流游动消耗能量，影响鱼类正常生长。
为了充分利用养殖海区和保持养殖海区的生态环境条件，防止养殖海区自污染而引起富营养化，造成鱼病流行，网箱设置面积不宜超过养殖海区面积的10%。网箱布局应与流向相适应，可使水流畅通。为了便于操作管理，可以两组并列排列，组与组间距80～100厘米，中间可设管理通道。列与列之间应在50米以上，网箱距海岸200米以上。
选择能在当地水域正常生长，而且生长快、养殖周期短、经济效益高的、放养大规格鱼种经当年饲养后产品即可上市的养殖品种。放养密度的确定，应根据水域中天然饵料生物量，网箱设置水流交换状况，鱼类生物学特征，网箱结构，饲养管理方式等综合因素来确定。通常放养密度5～10千克/立方米，最终养殖密度20～40千克立方米。及时分箱很重要，如3厘米大小的鲈鱼已能残食小个体的同类，所以应将大小分开。待长到10厘米左右时分一次箱，长到20厘米左右时进行第二次分箱。
在养殖饵料的选择、投喂方面，网箱养鱼使用的饵料有鲜、冻小杂鱼、小虾、扇贝边、贻贝肉及配合饲料等。新鲜饲料(冰鲜品、冷冻品)一般都能满足鱼类的营养需要，但变质腐败、解冻不完全的饲料不宜投喂。饵料投喂量当年鱼每天投喂体重的5%～30%，1龄鱼每天投喂体重的1%～10%。最好在每100千克饵料中加入100克多种维生素和200克胆碱，搅匀使用。投喂时要坚持定点、定时，根据鱼的情况，每日投喂3次，最少不少于2次，上、下午各1次。为了不使饵料残留、浪费，投喂时要慢投，不要让饵料沉入箱底。
在养殖生产中随着鱼体生长要适时更换网目较大的网衣，以利于幼鱼的生长，正常换网一般在30天左右。此外，网具上常会附着一些藻类、贝类及藤壶等附着生物，从而减少网箱的水体交换能力和增加网箱重量，因此必须定期用高压水枪清除附着生物；或者在网箱中放养少量杂食性鱼类，如鲻、篮子鱼、罗非鱼等，让其摄食附在网衣上的藻类、贝类等。
