棉籽饼是畜牧生产中常用来饲喂家畜的蛋白质饲料。但是，由于棉籽中含有对动物有害的棉酚及环丙烯脂肪酸，尤其是棉酚的危害很大。单胃动物过量摄取或摄取时间较长，可导致生长迟缓、繁殖性能及生产性能下降，甚至导致死亡。
虽然瘤胃微生物可以降解棉酚，使其毒性降低，但也应控制日粮中棉籽饼粕的比例。在母牛干奶期和种公牛日粮中，不要使用棉籽饼粕，犊牛日粮中可少量添加，成年母牛日粮中，棉籽饼粕的添加量一般不超过精料的20%，在架子牛育肥日粮中，棉籽饼粕可占精料的60%。对于去除棉籽饼棉酚毒素，可采用以下方法。
一是取草木灰或生石灰适量加入100千克清水中搅拌均匀，沉淀后取上清夜浸泡棉籽饼，饼液比例为2：1，浸泡24小时后再用清水滤液3～4遍，即可。二是在每百公斤土榨棉籽饼中加硫酸亚铁1.2～1.5千克，机榨粕只需加0.15～0.2千克，再以适量清水浸泡4～6小时即可。三是用2%的碳酸氢铵或1%的尿素溶液均匀喷洒在棉籽饼粉上充分拌匀，当饼粉中含水量达15%时为宜，然后用塑料薄膜密封闷24小时，即可饲用。四是用15%的纯碱溶液24千克喷洒在100千克棉籽饼粕上，充分拌匀用塑料薄膜密封闷5小时，然后蒸50分钟晾干。也可用浓度为1%的氢氧化钠溶液浸泡3～4小时后沥去溶液，用清水冲洗干净，晾干。110℃的高温下蒸煮3～5分钟。（甘肃省“12316三农”畜牧养殖专家李发庭）
